More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0199 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0199  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
366 aa  740    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0537  FAD dependent oxidoreductase  63.69 
 
 
369 aa  455  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0520  FAD dependent oxidoreductase  63.4 
 
 
369 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  60.11 
 
 
360 aa  449  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1461  FAD dependent oxidoreductase  54.35 
 
 
379 aa  421  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942129  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1793  FAD dependent oxidoreductase  52.04 
 
 
389 aa  394  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.075637  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  49.07 
 
 
381 aa  341  9e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1677  hypothetical protein  42.49 
 
 
365 aa  278  8e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.32351  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  26.23 
 
 
369 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19131  NAD binding site:D-amino acid oxidase  28.49 
 
 
360 aa  122  8e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.119558  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  27.25 
 
 
369 aa  119  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  29.33 
 
 
382 aa  119  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  25.68 
 
 
369 aa  119  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  25.68 
 
 
369 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  25.41 
 
 
369 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18391  NAD binding site:D-amino acid oxidase  30.33 
 
 
371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.299081  normal  0.626898 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  25.68 
 
 
369 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  25.68 
 
 
369 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1312  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 
368 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  25.68 
 
 
369 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21851  NAD binding site:D-amino acid oxidase  29.13 
 
 
370 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  25.14 
 
 
369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  25.14 
 
 
369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  27.3 
 
 
411 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  25.61 
 
 
369 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30031  NAD binding site:D-amino acid oxidase  29.82 
 
 
372 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  27.64 
 
 
371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  24.93 
 
 
378 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  28.03 
 
 
440 aa  110  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2673  D-amino acid oxidase  27.35 
 
 
350 aa  110  5e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1796  D-amino acid oxidase  28.49 
 
 
360 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229908  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  27.37 
 
 
404 aa  106  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  25.73 
 
 
372 aa  103  7e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18941  NAD binding site:D-amino acid oxidase  28.41 
 
 
360 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  27.3 
 
 
365 aa  102  9e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  30.23 
 
 
666 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  29.01 
 
 
367 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  25.14 
 
 
385 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  31.28 
 
 
652 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  29.94 
 
 
666 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2302  D-amino acid oxidase  29.41 
 
 
302 aa  97.1  5e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  25.27 
 
 
405 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  27.51 
 
 
373 aa  95.9  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18941  NAD binding site:D-amino acid oxidase  26.21 
 
 
360 aa  95.9  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  29.49 
 
 
652 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  26.36 
 
 
371 aa  95.9  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  28.05 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  24.52 
 
 
374 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  26.5 
 
 
401 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 
376 aa  92.4  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  26.95 
 
 
380 aa  92  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 
390 aa  91.3  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  23.81 
 
 
375 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  25.44 
 
 
417 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  26.89 
 
 
410 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  26.36 
 
 
385 aa  90.1  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  26.22 
 
 
393 aa  90.1  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  25.61 
 
 
368 aa  89  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  24.11 
 
 
376 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 
379 aa  88.6  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  25.38 
 
 
417 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 
385 aa  87  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 
419 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  23.91 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1490  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 
473 aa  82.8  0.000000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  27.52 
 
 
392 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  24.34 
 
 
375 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  24.86 
 
 
368 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  23.32 
 
 
391 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  25.85 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  23.72 
 
 
363 aa  80.1  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  24.35 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  24.01 
 
 
395 aa  80.5  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  26.97 
 
 
1033 aa  79.7  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  23.39 
 
 
371 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  23.39 
 
 
371 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  23.39 
 
 
371 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  23.1 
 
 
391 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.39 
 
 
371 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  23.1 
 
 
391 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  23.1 
 
 
391 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  22.91 
 
 
371 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  22.89 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  24.11 
 
 
361 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 
378 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  22.83 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  22.91 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  22.91 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  22.83 
 
 
391 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 
393 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 
367 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1552  FAD dependent oxidoreductase  26.08 
 
 
494 aa  77  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.374477  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  22.64 
 
 
371 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  24.4 
 
 
500 aa  76.6  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 
485 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  30 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  25.42 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
365 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000037  nopaline dehydrogenase putative  28.61 
 
 
365 aa  75.9  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>