243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_64520 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  100 
 
 		 177 aa  361  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  98.87 
 
 		 177 aa  357  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4448  Ferritin and Dps  78.49 
 
 		 180 aa  289  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  74.43 
 
 		 176 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  76.74 
 
 		 179 aa  281  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  73.3 
 
 		 176 aa  280  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  72.73 
 
 		 176 aa  277  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  74.43 
 
 		 176 aa  275  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  73.21 
 
 		 168 aa  267  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  72.02 
 
 		 187 aa  254  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  68.24 
 
 		 185 aa  250  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  68.24 
 
 		 185 aa  248  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  66.86 
 
 		 191 aa  240  7e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1509  Ferritin Dps family protein  69.64 
 
 		 181 aa  240  7.999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55793  normal  0.936849 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  64.46 
 
 		 196 aa  228  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2657  Ferritin Dps family protein  66.27 
 
 		 190 aa  220  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.6432 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02642  bacterioferritin  61.4 
 
 		 186 aa  212  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  59.06 
 
 		 181 aa  211  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1459  bacterioferritin  64.5 
 
 		 190 aa  210  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491219  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  60.24 
 
 		 184 aa  208  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  56.8 
 
 		 174 aa  207  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  57.74 
 
 		 192 aa  201  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  58.86 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  56.4 
 
 		 181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  56.4 
 
 		 181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  54.72 
 
 		 194 aa  191  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2663  Ferritin and Dps  55.36 
 
 		 257 aa  188  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0895  Ferritin Dps family protein  48.81 
 
 		 187 aa  166  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.743965 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1402  Ferritin, Dps family protein  40.49 
 
 		 182 aa  103  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0582  bacterioferritin  33.33 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0017201  normal  0.223999 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  34.03 
 
 		 164 aa  90.1  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0092  Ferritin Dps family protein  34.03 
 
 		 164 aa  89  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.523921  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  34.03 
 
 		 164 aa  88.6  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  34.03 
 
 		 164 aa  87  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  32.17 
 
 		 164 aa  85.9  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  32.64 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  32.64 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  30.61 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1760  Ferritin and Dps  30.2 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0104  Ferritin Dps family protein  30.14 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  34.29 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1706  Ferritin Dps family protein  30.82 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2517  Ferritin Dps family protein  30.82 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.239409 
 
 
-
 
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  34.78 
 
 		 275 aa  65.1  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  33.58 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  35.29 
 
 		 158 aa  62  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  30.77 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  33.33 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  35.17 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  34.07 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  34 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2930  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00884055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0839  rubrerythrin  32.17 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.170782  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  37.78 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  33.33 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  34.48 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  34.48 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  30.07 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  34.06 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1332  bacterioferritin  34.07 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  37.04 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0706  bacterioferritin  33.83 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.95756 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  30.15 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  30.15 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  31.47 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  34.72 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  33.82 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  32.35 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  31.25 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  31.47 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1981  Ferritin Dps family protein  28.48 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4256  Ferritin Dps family protein  27.08 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4317  Ferritin Dps family protein  27.08 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000113171  hitchhiker  0.0023195 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1788  Dps family ferritin  27.81 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  31.29 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  30.07 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  32.59 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  31.25 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  34.81 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  31.58 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0171  Ferritin Dps family protein  31.97 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3019  bacterioferritin  31.69 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3043  bacterioferritin  31.39 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0657083  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3322  bacterioferritin  31.25 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.636204  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  34.72 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2250  bacterioferritin  31.01 
 
 		 157 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0153548  decreased coverage  0.00706074 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1628  Ferritin Dps family protein  31.97 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11904  bacterioferritin bfrA  31.58 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.817982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2757  bacterioferritin  32.33 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  33.58 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  33.58 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2801  bacterioferritin  32.33 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0659716  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1675  Ferritin, Dps family protein  28.36 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  31.62 
 
 		 161 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2787  bacterioferritin  32.33 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  32.84 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1762  Ferritin and Dps  26.21 
 
 		 144 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.915655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  32.59 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  32.62 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  34.07 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>