59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_24100 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_24100  general secretion pathway protein M  100 
 
 		 174 aa  340  5e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000242731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2038  general secretion pathway protein M  95.98 
 
 		 174 aa  311  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2917  general secretion pathway M protein  60.69 
 
 		 174 aa  150  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1407  general secretion pathway protein M  37.82 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0117156  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1357  general secretion pathway M protein  35.06 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0259  general secretion pathway M protein  28.76 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.510842  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4582  general secretion pathway protein M  24.82 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0237  General secretion pathway M protein  34.87 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2297  cholera toxin secretion protein EpsM  28.21 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1421  General secretion pathway M protein  30.77 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2384  general secretion pathway M protein  36.65 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000664832 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2851  General secretion pathway M protein  32.85 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0012  EtpM  32.81 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.804249 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3610  general secretion pathway M protein  26.53 
 
 		 158 aa  52  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3558  general secretion pathway M protein  28.17 
 
 		 158 aa  52.4  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0042  general secretion pathway M protein  32.91 
 
 		 168 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2387  general secretion pathway M protein  29.55 
 
 		 174 aa  51.6  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3946  General secretion pathway M protein  31.06 
 
 		 167 aa  51.2  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.487407  normal  0.51049 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0160  general secretion pathway M protein  27.2 
 
 		 158 aa  50.8  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0165  general secretion pathway M protein  27.2 
 
 		 158 aa  50.8  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0163  General secretion pathway M protein  26.4 
 
 		 158 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0052  general secretion pathway M protein  34.23 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2915  general secretion pathway protein M  26.11 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1479  General secretion pathway M protein  33.1 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0728  General secretion pathway M protein  26.45 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0175  general secretion pathway protein M  27.2 
 
 		 158 aa  50.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0160  general secretion pathway M protein  27.2 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4491  putative general secretory pathway protein M  33.33 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.584495  normal  0.0347448 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4725  general secretion pathway M protein  27.48 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3238  putative general secretion pathway protein YghD  25.62 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.310294  normal  0.927971 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0162  general secretion pathway M protein  25.81 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0482645 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0130  general secretion pathway M protein  28.57 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03965  general secretion pathway protein M  21.48 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0158  general secretion pathway M protein  26.4 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1308  General secretion pathway M protein  33.79 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02778  hypothetical protein  26.45 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000246305  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3418  putative general secretion pathway protein YghD  26.45 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02829  predicted secretion pathway M-type protein, membrane anchored  26.45 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000034154  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4197  general secretion pathway M protein  25.81 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3129  putative general secretion pathway protein YghD  26.45 
 
 		 178 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0230  general secretory pathway protein M  31.71 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2775  general secretion pathway protein M  31.71 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3403  putative general secretion pathway protein YghD  26.45 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0018  general secretory pathway protein M  31.71 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687218  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0114  general secretion pathway M protein  24.59 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3508  general secretion pathway protein M  31.71 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.928199  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1880  general secretion pathway protein M  31.71 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121479  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2672  general secretion pathway protein M  31.71 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.126224  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0018  general secretory pathway protein M  31.71 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.563775  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3080  general secretion pathway M protein  30.46 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233013  hitchhiker  0.000000230148 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0017  general secretion pathway protein M  31.1 
 
 		 168 aa  45.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001883  general secretion pathway protein M  24.29 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0153  general secretion pathway M protein  26.4 
 
 		 158 aa  44.7  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.122002  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0390  general secretion pathway M protein  26.17 
 
 		 165 aa  44.7  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.383902 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4349  general secretion pathway M protein  22.95 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00610  general secretion pathway protein M  23.87 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3234  general secretion pathway M protein  33.33 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.108205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0178  general secretion pathway protein M  23.58 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0577682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3390  general secretion pathway M protein  31.78 
 
 		 188 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>