46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_18371 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_18371  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 		 333 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1739  DNA polymerase III subunit delta  71.69 
 
 		 333 aa  471  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.353532  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18561  DNA polymerase III subunit delta  70.57 
 
 		 333 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.318986  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18371  DNA polymerase III subunit delta  69.97 
 
 		 333 aa  465  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.926744  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00831  DNA polymerase III subunit delta  35.93 
 
 		 336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  34.44 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17731  DNA polymerase III subunit delta  38.74 
 
 		 335 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  35.35 
 
 		 321 aa  215  9e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21151  DNA polymerase III subunit delta  38.1 
 
 		 342 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1245  DNA polymerase III subunit delta  38.14 
 
 		 342 aa  206  6e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  32.13 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  32.13 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  29.73 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  27.46 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  28.53 
 
 		 329 aa  159  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  27.03 
 
 		 332 aa  153  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  28.62 
 
 		 328 aa  145  9e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  28.31 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5512  DNA polymerase III, delta subunit  29.34 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.504789 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0083  DNA polymerase III subunit delta  25.85 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  22.92 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5666  DNA polymerase III, delta subunit  24.92 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  23.01 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  23.19 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  21.84 
 
 		 344 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  22.19 
 
 		 329 aa  52.8  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  23.69 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  18.01 
 
 		 348 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  22.15 
 
 		 336 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  22.15 
 
 		 336 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  21.78 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  23.48 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  21.05 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  22.89 
 
 		 344 aa  47.8  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  20.92 
 
 		 336 aa  47  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  22.92 
 
 		 315 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  21.85 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  21.85 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  21.85 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  21.85 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  23.08 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  21.85 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  22.47 
 
 		 336 aa  43.5  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  26.04 
 
 		 354 aa  43.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  23.03 
 
 		 345 aa  43.1  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  22.28 
 
 		 331 aa  42.7  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>