More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_24681 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_24681  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  100 
 
 		 210 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0257  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  68 
 
 		 204 aa  283  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03331  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  62.12 
 
 		 206 aa  275  4e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1621  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  62.12 
 
 		 206 aa  272  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2087  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  65.15 
 
 		 204 aa  273  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02811  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  56.16 
 
 		 207 aa  248  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02781  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  54.4 
 
 		 212 aa  231  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02881  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  51.49 
 
 		 206 aa  228  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.130398  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0257  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  54.95 
 
 		 207 aa  227  8e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.420219  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3629  isopropylmalate isomerase small subunit  52.63 
 
 		 206 aa  225  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2548  isopropylmalate isomerase small subunit  58.95 
 
 		 202 aa  224  9e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0488432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02771  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  51.49 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.385201  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1327  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.04 
 
 		 197 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.507856  normal  0.452578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3966  isopropylmalate isomerase small subunit  51.31 
 
 		 202 aa  211  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.05677  normal  0.0175805 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5027  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  52.63 
 
 		 201 aa  210  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.162476  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3761  isopropylmalate isomerase small subunit  52.85 
 
 		 197 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3810  isopropylmalate isomerase small subunit  52.85 
 
 		 197 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0321  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.26 
 
 		 203 aa  204  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00352929  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0871  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.74 
 
 		 217 aa  199  3e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2657  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.67 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0900  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.74 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0643  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.85 
 
 		 206 aa  181  5.0000000000000004e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2764  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.5 
 
 		 211 aa  179  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1847  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  46.07 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2681  isopropylmalate isomerase small subunit  44.85 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1545  aconitate hydratase domain protein  46.15 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.831045  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1602  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.03 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0187865 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0667  isopropylmalate isomerase small subunit  41.58 
 
 		 202 aa  149  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0126  isopropylmalate isomerase small subunit  39.64 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  0.029238 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0121  isopropylmalate isomerase small subunit  39.05 
 
 		 201 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886111  normal  0.157977 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0126  isopropylmalate isomerase small subunit  39.05 
 
 		 201 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0119  isopropylmalate isomerase small subunit  39.05 
 
 		 201 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0122  isopropylmalate isomerase small subunit  38.46 
 
 		 201 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14126  normal  0.46492 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03088  isopropylmalate isomerase small subunit  40.83 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3469  isopropylmalate isomerase small subunit  41.32 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.068645  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4709  isopropylmalate isomerase small subunit  38.97 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3271  isopropylmalate isomerase small subunit  39.01 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  35.42 
 
 		 200 aa  112  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0076  isopropylmalate isomerase small subunit  34.92 
 
 		 201 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0078  isopropylmalate isomerase small subunit  34.92 
 
 		 201 aa  111  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00073  isopropylmalate isomerase small subunit  34.92 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3527  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  34.92 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0074  isopropylmalate isomerase small subunit  34.92 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3586  isopropylmalate isomerase small subunit  34.92 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0076  isopropylmalate isomerase small subunit  36.75 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0065  isopropylmalate isomerase small subunit  34.92 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00072  hypothetical protein  34.92 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  35.71 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3888  isopropylmalate isomerase small subunit  36.14 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  40.12 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1456  isopropylmalate isomerase small subunit  36.14 
 
 		 193 aa  109  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3817  isopropylmalate isomerase small subunit  40.12 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0396  isopropylmalate isomerase small subunit  36.84 
 
 		 201 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184497 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0414  isopropylmalate isomerase small subunit  39.52 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000110574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0388  isopropylmalate isomerase small subunit  39.52 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4547  isopropylmalate isomerase small subunit  35.79 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.258236  normal  0.011903 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0400  isopropylmalate isomerase small subunit  39.52 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1523  isopropylmalate isomerase small subunit  36.84 
 
 		 193 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1287  isopropylmalate isomerase small subunit  35.54 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0474  isopropylmalate isomerase small subunit  40.12 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0619  isopropylmalate isomerase small subunit  36.09 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1446  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  35.56 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00452839  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0963  isopropylmalate isomerase small subunit  37.72 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4233  isopropylmalate isomerase small subunit  36.84 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1288  isopropylmalate isomerase small subunit  35.54 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0234  isopropylmalate isomerase small subunit  40.28 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0629  isopropylmalate isomerase small subunit  34.9 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1382  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  35.56 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  0.419844 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001659  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  34.9 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3825  isopropylmalate isomerase small subunit  35.26 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1670  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  37.82 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00715412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2939  isopropylmalate isomerase small subunit  38.22 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3538  isopropylmalate isomerase small subunit  38.22 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  35.42 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00814  isopropylmalate isomerase small subunit  34.9 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2521  isopropylmalate isomerase small subunit  35.42 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3408  isopropylmalate isomerase small subunit  37.58 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0296  isopropylmalate isomerase small subunit  38.32 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1314  isopropylmalate isomerase small subunit  34.94 
 
 		 193 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0340  isopropylmalate isomerase small subunit  38.32 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1423  isopropylmalate isomerase small subunit  34.94 
 
 		 193 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0159  isopropylmalate isomerase small subunit  37.82 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  38.46 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1494  isopropylmalate isomerase small subunit  34.94 
 
 		 193 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0372  isopropylmalate isomerase small subunit  37.72 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3028  isopropylmalate isomerase small subunit  38.1 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295047 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1979  isopropylmalate isomerase small subunit  39.34 
 
 		 191 aa  104  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0337  isopropylmalate isomerase small subunit  34.74 
 
 		 201 aa  104  9e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2148  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  36.47 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0323042  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0374  isopropylmalate isomerase small subunit  36.69 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0626  isopropylmalate isomerase small subunit  38.99 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1704  isopropylmalate isomerase small subunit  34.13 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  hitchhiker  0.00210823 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  38.18 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0776  isopropylmalate isomerase small subunit  38.99 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1325  isopropylmalate isomerase small subunit  36.97 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1173  isopropylmalate isomerase small subunit  40 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.981045  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1562  isopropylmalate isomerase small subunit  34.34 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2131  isopropylmalate isomerase small subunit  37.5 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3585  isopropylmalate isomerase small subunit  35.79 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0371  isopropylmalate isomerase small subunit  35.79 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>