More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_14231 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_14231  hypothetical protein  100 
 
 		 586 aa  1167    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14091  hypothetical protein  37.63 
 
 		 599 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29930  ABC transporter protein  33.51 
 
 		 613 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292656  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0523  ABC transporter related  35.51 
 
 		 571 aa  366  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1312  ATPase  32.93 
 
 		 600 aa  348  2e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1332  ATPase  34.75 
 
 		 576 aa  323  6e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00148661  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14501  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  34.09 
 
 		 586 aa  309  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0617  ABC transporter related protein  30.02 
 
 		 611 aa  277  4e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.10554  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  27.89 
 
 		 600 aa  270  4e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  27.07 
 
 		 625 aa  266  5.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100334 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0788  ABC transporter related  30.12 
 
 		 600 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01541  hypothetical protein  32 
 
 		 552 aa  252  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.29572  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2355  ABC transporter related  28.06 
 
 		 603 aa  248  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.916251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1562  ABC transporter related  27.45 
 
 		 605 aa  243  5e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.36588  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0373  ABC transporter-related protein  26.12 
 
 		 594 aa  243  7e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2624  ABC transporter related  27.4 
 
 		 596 aa  243  7e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2847  ABC transporter related  27.4 
 
 		 586 aa  242  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.682439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2654  ABC transporter related  28.14 
 
 		 596 aa  242  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0652  efflux ABC transporter ATP-binding protein  29.55 
 
 		 599 aa  240  5e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0177211  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1411  ATPase  30.69 
 
 		 611 aa  234  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01101  hypothetical protein  30.69 
 
 		 611 aa  233  5e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5187  ABC transporter related  29.04 
 
 		 585 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1383  ATPase  29.82 
 
 		 614 aa  231  3e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.267423 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0122  ABC transporter related  27.48 
 
 		 628 aa  229  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3900  ABC transporter related  25.93 
 
 		 568 aa  228  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2356  ABC transporter related  29.36 
 
 		 583 aa  227  4e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2527  ABC transporter related protein  30.12 
 
 		 599 aa  226  9e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0489223 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00581  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  28.6 
 
 		 610 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.779768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2068  ABC transporter related  27.48 
 
 		 583 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561392  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2172  ABC transporter related  31.35 
 
 		 610 aa  213  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1117  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.27 
 
 		 601 aa  207  4e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0898  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  27.09 
 
 		 601 aa  206  1e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.32 
 
 		 564 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0168  ATPase  27.39 
 
 		 612 aa  197  4.0000000000000005e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.334889  normal  0.167658 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  27.59 
 
 		 564 aa  195  2e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.69 
 
 		 564 aa  194  5e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08650  ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporter with N-terminal double-glycine peptidase domain  31.25 
 
 		 606 aa  192  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3896  ABC transporter related  28.08 
 
 		 626 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.227189  normal  0.0393821 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.21 
 
 		 564 aa  191  4e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0410  ABC transporter related  25.13 
 
 		 610 aa  190  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.17 
 
 		 600 aa  189  8e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25671  putative ABC transporter  28.93 
 
 		 605 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2121  ABC transporter related  32.56 
 
 		 592 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0469837  normal  0.034956 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4465  ABC transporter related  32.31 
 
 		 585 aa  184  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269199 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3273  ABC transporter related  25.7 
 
 		 607 aa  183  7e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1342  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.3 
 
 		 588 aa  183  9.000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2971  hypothetical protein  26.43 
 
 		 610 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.570189  normal  0.54511 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  27.81 
 
 		 618 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0610  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.97 
 
 		 587 aa  177  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  26.74 
 
 		 739 aa  177  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4581  ABC transporter related  29.83 
 
 		 613 aa  177  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  29.78 
 
 		 616 aa  176  8e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  29.57 
 
 		 597 aa  176  9e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.47 
 
 		 602 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.94 
 
 		 583 aa  175  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  28.57 
 
 		 596 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  27.47 
 
 		 720 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  27.27 
 
 		 720 aa  172  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0198  ATPase  26.49 
 
 		 613 aa  172  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.312948  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.22 
 
 		 574 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.22 
 
 		 574 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.43 
 
 		 555 aa  171  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.14 
 
 		 578 aa  171  3e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  30.6 
 
 		 593 aa  171  4e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  30.98 
 
 		 577 aa  171  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2388  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.27 
 
 		 600 aa  171  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.496768  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1979  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.18 
 
 		 589 aa  171  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  29.55 
 
 		 572 aa  171  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1641  ABC transporter, transmembrane region, type 1  37.2 
 
 		 574 aa  170  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  28.38 
 
 		 596 aa  170  8e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0757  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  25.59 
 
 		 594 aa  170  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00726386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  28.57 
 
 		 578 aa  169  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  25.82 
 
 		 592 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1312  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  33.83 
 
 		 589 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000743018  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  28.57 
 
 		 578 aa  169  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2533  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.61 
 
 		 590 aa  169  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611222  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3683  ATPase  24.89 
 
 		 603 aa  169  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  38.99 
 
 		 579 aa  168  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.21 
 
 		 613 aa  168  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  32.49 
 
 		 586 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2054  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.51 
 
 		 593 aa  167  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0384  multidrug ABC transporter  39.61 
 
 		 578 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 		 604 aa  167  4e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  29.17 
 
 		 601 aa  167  4e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1803  ATPase  30.04 
 
 		 649 aa  167  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0957  hypothetical protein  28.17 
 
 		 593 aa  167  4e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  36.54 
 
 		 573 aa  167  5.9999999999999996e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.9 
 
 		 587 aa  167  6.9999999999999995e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.33 
 
 		 600 aa  166  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  30.99 
 
 		 578 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  29.16 
 
 		 609 aa  166  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  29.53 
 
 		 572 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  27.55 
 
 		 586 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  27.81 
 
 		 556 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1371  ABC transporter-related protein  38.39 
 
 		 613 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  27.9 
 
 		 738 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1246  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.27 
 
 		 606 aa  164  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  26.44 
 
 		 976 aa  164  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  29.49 
 
 		 612 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  26.82 
 
 		 971 aa  164  5.0000000000000005e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>