More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_12141 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_13041  DNA polymerase I  59.84 
 
 		 976 aa  1204    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0748  DNA polymerase I  66.73 
 
 		 986 aa  1341    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100174  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08691  DNA polymerase I  69.07 
 
 		 986 aa  1412    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0581  DNA polymerase I  48.64 
 
 		 977 aa  873    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0693  DNA polymerase I  65.93 
 
 		 998 aa  1369    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.433628  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1966  DNA polymerase I  67.31 
 
 		 986 aa  1373    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.378529 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13151  DNA polymerase I  60.92 
 
 		 976 aa  1206    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1236  DNA polymerase I  61.2 
 
 		 976 aa  1214    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  53.77 
 
 		 953 aa  966    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0136  DNA polymerase I  48.89 
 
 		 982 aa  868    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.3801  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15881  DNA polymerase I  67.34 
 
 		 986 aa  1352    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.65374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4231  DNA polymerase I  49.9 
 
 		 966 aa  899    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3011  DNA polymerase I  51.3 
 
 		 972 aa  916    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3109  DNA polymerase I  51.3 
 
 		 972 aa  916    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0546  DNA polymerase I  46.2 
 
 		 1045 aa  864    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13291  DNA polymerase I  59.84 
 
 		 976 aa  1196    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0850  DNA polymerase I  49 
 
 		 982 aa  899    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0300789 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12141  DNA polymerase I  100 
 
 		 985 aa  2011    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.503839 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  37.1 
 
 		 891 aa  582  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  37.03 
 
 		 892 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  36.2 
 
 		 903 aa  569  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  36.87 
 
 		 912 aa  560  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  37.5 
 
 		 911 aa  562  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  37.47 
 
 		 926 aa  558  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  38.17 
 
 		 893 aa  558  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  36.76 
 
 		 950 aa  552  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  37.76 
 
 		 908 aa  550  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  37.37 
 
 		 945 aa  552  1e-155  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  37.13 
 
 		 892 aa  549  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  37.27 
 
 		 930 aa  550  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  35.77 
 
 		 891 aa  547  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  36.69 
 
 		 911 aa  547  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  36.51 
 
 		 934 aa  546  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  37.13 
 
 		 936 aa  546  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1062  DNA polymerase I  36.02 
 
 		 934 aa  549  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  36.08 
 
 		 892 aa  542  1e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  36.9 
 
 		 928 aa  545  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  37.45 
 
 		 892 aa  545  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  36.46 
 
 		 934 aa  545  1e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  37.34 
 
 		 892 aa  545  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  36.28 
 
 		 944 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  36.5 
 
 		 951 aa  539  9.999999999999999e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  37.84 
 
 		 915 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  36.35 
 
 		 968 aa  536  1e-151  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  37.9 
 
 		 915 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  35.82 
 
 		 930 aa  538  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  36.68 
 
 		 899 aa  538  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  35.24 
 
 		 949 aa  536  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  36.68 
 
 		 899 aa  538  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  36.24 
 
 		 928 aa  536  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  35.66 
 
 		 930 aa  535  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0299  DNA polymerase I  36.49 
 
 		 992 aa  535  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  36.23 
 
 		 896 aa  533  1e-150  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1325  DNA polymerase I  36.11 
 
 		 957 aa  535  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  35.42 
 
 		 939 aa  535  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  36.26 
 
 		 908 aa  535  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  37.64 
 
 		 915 aa  535  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  35.81 
 
 		 942 aa  530  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  36.02 
 
 		 924 aa  530  1e-149  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  35.71 
 
 		 979 aa  531  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  36.35 
 
 		 928 aa  532  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  36.52 
 
 		 888 aa  530  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  36.64 
 
 		 931 aa  531  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3415  DNA polymerase I  35.17 
 
 		 965 aa  532  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208167  normal  0.0804526 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1637  DNA polymerase I  34.77 
 
 		 936 aa  526  1e-148  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  37.37 
 
 		 915 aa  529  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  35.6 
 
 		 916 aa  529  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  36.32 
 
 		 943 aa  527  1e-148  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3243  DNA polymerase I  36.18 
 
 		 917 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0154529 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3769  DNA polymerase I  35.98 
 
 		 917 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.662383  hitchhiker  0.00614094 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  35.2 
 
 		 906 aa  524  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  35.62 
 
 		 903 aa  523  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  37.04 
 
 		 935 aa  523  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2218  DNA polymerase I  36.06 
 
 		 917 aa  524  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  36.17 
 
 		 939 aa  524  1e-147  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  36.32 
 
 		 988 aa  524  1e-147  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  36.11 
 
 		 933 aa  524  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  35.26 
 
 		 924 aa  523  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  34.8 
 
 		 946 aa  526  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  37.01 
 
 		 928 aa  521  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  37.01 
 
 		 928 aa  521  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  37.01 
 
 		 928 aa  521  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  37.01 
 
 		 928 aa  521  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4827  DNA polymerase I  35.48 
 
 		 917 aa  522  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00421235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  35.11 
 
 		 923 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  35.18 
 
 		 926 aa  522  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  35.18 
 
 		 926 aa  522  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  35.11 
 
 		 940 aa  520  1e-146  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  35.11 
 
 		 923 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  34.97 
 
 		 941 aa  521  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  35.18 
 
 		 926 aa  522  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  35.11 
 
 		 923 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  35.08 
 
 		 926 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  37.01 
 
 		 928 aa  521  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  35.18 
 
 		 926 aa  522  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  35.83 
 
 		 934 aa  520  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  37.01 
 
 		 928 aa  520  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  37.01 
 
 		 928 aa  521  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  36.91 
 
 		 928 aa  520  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  34.93 
 
 		 932 aa  520  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>