203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4333 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4333  amidohydrolase  100 
 
 		 424 aa  855    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.48776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0462  amidohydrolase  34.53 
 
 		 401 aa  196  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000842595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1571  amidohydrolase  34.55 
 
 		 392 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0206923  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2402  amidohydrolase  33.17 
 
 		 397 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2941  amidohydrolase  31.95 
 
 		 390 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.270763  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  28.35 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  30.57 
 
 		 440 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  29.05 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  29.9 
 
 		 423 aa  124  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  30.66 
 
 		 426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  29.48 
 
 		 455 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  31.47 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  28.99 
 
 		 407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  27.68 
 
 		 401 aa  110  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  27.48 
 
 		 391 aa  110  7.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  27.59 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  28.23 
 
 		 426 aa  107  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  28.87 
 
 		 433 aa  107  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  28.71 
 
 		 426 aa  106  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  28.6 
 
 		 430 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  26.88 
 
 		 431 aa  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  26.74 
 
 		 470 aa  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  27.32 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  29.61 
 
 		 432 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  27.1 
 
 		 444 aa  100  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  29.41 
 
 		 421 aa  100  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  29.67 
 
 		 480 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  28.24 
 
 		 438 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  28.3 
 
 		 459 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  24.15 
 
 		 413 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  25.3 
 
 		 437 aa  95.1  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  27.81 
 
 		 423 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  26.92 
 
 		 433 aa  94  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  25.89 
 
 		 445 aa  93.6  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  26.29 
 
 		 432 aa  91.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4704  amidohydrolase  25.91 
 
 		 424 aa  90.5  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  25.95 
 
 		 444 aa  90.5  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  26.94 
 
 		 421 aa  90.1  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  28.4 
 
 		 415 aa  90.1  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  26.92 
 
 		 430 aa  89  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  26.32 
 
 		 407 aa  87.8  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  26.2 
 
 		 405 aa  88.2  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  28.33 
 
 		 428 aa  87.4  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  30.13 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  27.82 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  27.54 
 
 		 418 aa  84  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2275  amidohydrolase  26.47 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  25.89 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1522  amidohydrolase  26 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0533658 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  23.61 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  28.99 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  26.29 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  27.4 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  31.15 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  24.69 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  27.88 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  24.46 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  27.58 
 
 		 409 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  25.28 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  27.58 
 
 		 409 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  25.54 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  26.29 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2674  amidohydrolase  28.18 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  26.76 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  31.69 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  31.69 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  31.69 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  29.26 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  26.6 
 
 		 396 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  26.24 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  27.75 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  28.32 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  26.17 
 
 		 431 aa  79  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  25.74 
 
 		 448 aa  79  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  25.19 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  26.18 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  27.11 
 
 		 440 aa  76.3  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  26.59 
 
 		 419 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18800  amidohydrolase, imidazolonepropionase  28.33 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0282711  normal  0.197659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  31.36 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  27.32 
 
 		 461 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  24.27 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  24.39 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3221  amidohydrolase  29.41 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000000027233  hitchhiker  0.000156349 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2486  amidohydrolase  26.45 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445092  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  24.52 
 
 		 434 aa  73.2  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  26.22 
 
 		 426 aa  73.2  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  25.9 
 
 		 409 aa  72.8  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  26.3 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  26.46 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  28.57 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  27.63 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  25.67 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  30.13 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  23.62 
 
 		 585 aa  70.1  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  24.41 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  25.82 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  25.82 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  25.82 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  31.4 
 
 		 419 aa  69.7  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>