200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2941 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2941  amidohydrolase  100 
 
 
390 aa  801    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.270763  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0462  amidohydrolase  38.55 
 
 
401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000842595  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4333  amidohydrolase  31.95 
 
 
424 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.48776  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1571  amidohydrolase  30.06 
 
 
392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0206923  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  28.7 
 
 
401 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2402  amidohydrolase  30.84 
 
 
397 aa  123  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  28.71 
 
 
400 aa  123  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  30.14 
 
 
423 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  28.43 
 
 
407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  25.65 
 
 
430 aa  110  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  26.98 
 
 
448 aa  110  6e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  27.73 
 
 
391 aa  109  7.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  27.71 
 
 
413 aa  109  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  29.64 
 
 
440 aa  107  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  25 
 
 
455 aa  106  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  27.41 
 
 
426 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  26.72 
 
 
408 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  27.61 
 
 
410 aa  101  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  26.72 
 
 
408 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  26.72 
 
 
408 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  27.86 
 
 
431 aa  100  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  27.25 
 
 
422 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  28.79 
 
 
433 aa  100  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  26.26 
 
 
431 aa  99.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  25.8 
 
 
430 aa  98.6  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  27.06 
 
 
437 aa  98.2  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  27.5 
 
 
441 aa  97.4  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  26.9 
 
 
426 aa  97.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  26.18 
 
 
407 aa  97.1  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  27.59 
 
 
421 aa  96.3  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  27.46 
 
 
422 aa  95.9  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  27.27 
 
 
445 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  28.92 
 
 
417 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1522  amidohydrolase  28.06 
 
 
429 aa  94  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0533658 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2674  amidohydrolase  26.43 
 
 
394 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  26.52 
 
 
444 aa  92  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  27.75 
 
 
404 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  26.58 
 
 
411 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  26.77 
 
 
403 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  27.74 
 
 
434 aa  90.5  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  26.51 
 
 
415 aa  90.5  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  28.16 
 
 
405 aa  90.1  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  29.02 
 
 
426 aa  89.7  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  27.95 
 
 
428 aa  89.7  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  27.19 
 
 
432 aa  89.7  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  27.6 
 
 
396 aa  88.2  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  25.55 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  26.64 
 
 
436 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  27.05 
 
 
426 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  26.63 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  26.63 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  27.86 
 
 
412 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  26.63 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  25.33 
 
 
419 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  25.52 
 
 
407 aa  87.8  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  23.4 
 
 
407 aa  87.4  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  27 
 
 
438 aa  87.4  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  25.55 
 
 
405 aa  86.7  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  27.3 
 
 
416 aa  86.7  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  25 
 
 
438 aa  86.3  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  25.51 
 
 
419 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  28.08 
 
 
433 aa  85.1  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  27.54 
 
 
423 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1562  amidohydrolase 3  29.13 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345787  normal  0.0640888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  25.97 
 
 
402 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  26.35 
 
 
419 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  26.83 
 
 
444 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  25.27 
 
 
420 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  25.4 
 
 
428 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  24.55 
 
 
412 aa  83.2  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  24.84 
 
 
411 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  27.3 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  27.59 
 
 
409 aa  82  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  25.18 
 
 
405 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  26.79 
 
 
403 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  27.49 
 
 
426 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  24.68 
 
 
429 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  26.33 
 
 
433 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  24.7 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  25.27 
 
 
413 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  25.27 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0984  amidohydrolase  26.85 
 
 
358 aa  80.5  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000713577  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  24.55 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4704  amidohydrolase  25.07 
 
 
424 aa  79.7  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  24.55 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  26.2 
 
 
402 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  26.67 
 
 
390 aa  79  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2275  amidohydrolase  25.15 
 
 
450 aa  78.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776694  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  27.03 
 
 
432 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  26.81 
 
 
414 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  24.86 
 
 
459 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  25.09 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3142  amidohydrolase  29.54 
 
 
359 aa  78.2  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000508689  normal  0.129698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5929  amidohydrolase  27.87 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117607  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  28.21 
 
 
433 aa  77.4  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2226  amidohydrolase  26.58 
 
 
360 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000139869 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23760  amidohydrolase, imidazolonepropionase  27.6 
 
 
378 aa  77  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  26.32 
 
 
440 aa  76.6  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12929  hypothetical protein  27.6 
 
 
370 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0687  normal  0.519945 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  25.82 
 
 
445 aa  75.5  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>