135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2486 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2486  amidohydrolase  100 
 
 		 360 aa  711    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445092  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2226  amidohydrolase  75.28 
 
 		 360 aa  528  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000139869 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11020  amidohydrolase, imidazolonepropionase  58.26 
 
 		 366 aa  395  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.161229  normal  0.0546284 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1397  amidohydrolase  57.38 
 
 		 359 aa  383  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  decreased coverage  0.00549847 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3262  amidohydrolase  53.11 
 
 		 361 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3462  amidohydrolase 3  58.43 
 
 		 365 aa  356  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1281  amidohydrolase  55.15 
 
 		 364 aa  345  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5929  amidohydrolase  53.65 
 
 		 356 aa  339  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117607  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2182  amidohydrolase  54.52 
 
 		 360 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322343  normal  0.931322 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12929  hypothetical protein  53.45 
 
 		 370 aa  335  7e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0687  normal  0.519945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4010  amidohydrolase  54.37 
 
 		 361 aa  335  7.999999999999999e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1469  amidohydrolase  50.69 
 
 		 362 aa  322  5e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145414 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1562  amidohydrolase 3  51.69 
 
 		 362 aa  322  5e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345787  normal  0.0640888 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09720  Pro-Hyp dipeptidase  52.82 
 
 		 354 aa  318  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.885607 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23760  amidohydrolase, imidazolonepropionase  47.77 
 
 		 378 aa  311  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1960  amidohydrolase  55.03 
 
 		 368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2006  amidohydrolase  55.03 
 
 		 368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0811412  normal  0.722686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1940  amidohydrolase  55.03 
 
 		 368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.864175 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1612  amidohydrolase  50.3 
 
 		 358 aa  296  4e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0569822  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1166  amidohydrolase  49.16 
 
 		 373 aa  295  8e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09960  amidohydrolase, imidazolonepropionase  48.6 
 
 		 388 aa  288  8e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0916327  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2082  amidohydrolase  47.83 
 
 		 357 aa  285  9e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4181  amidohydrolase  51.15 
 
 		 362 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0984  amidohydrolase  46.72 
 
 		 358 aa  280  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000713577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1191  amidohydrolase  47.5 
 
 		 359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251504  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2244  amidohydrolase  46.22 
 
 		 367 aa  263  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.209508 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1302  amidohydrolase  46.99 
 
 		 359 aa  257  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3142  amidohydrolase  47.87 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000508689  normal  0.129698 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  27.22 
 
 		 407 aa  90.9  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  28.53 
 
 		 426 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  26.46 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  24.56 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  27.25 
 
 		 440 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  28.53 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  28.11 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  27.23 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  28.85 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  28.85 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  28.85 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1571  amidohydrolase  28.53 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0206923  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  26.16 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  25.5 
 
 		 426 aa  76.3  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  29.48 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  25.49 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4333  amidohydrolase  26.45 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.48776  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  25.42 
 
 		 396 aa  72  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  25.33 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  28.39 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  28.33 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  26.84 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  27.52 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  25.37 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  28.69 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  25.51 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  31.05 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  31.05 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  31.05 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  23.96 
 
 		 390 aa  67  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18800  amidohydrolase, imidazolonepropionase  30.21 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0282711  normal  0.197659 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  23.3 
 
 		 413 aa  67  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2941  amidohydrolase  25 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.270763  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  32.26 
 
 		 421 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  24.64 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  24.2 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3597  amidohydrolase  31.22 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3221  amidohydrolase  27.45 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000000027233  hitchhiker  0.000156349 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  27.65 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2402  amidohydrolase  25.56 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  23.82 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  26.76 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  26.14 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0462  amidohydrolase  28.66 
 
 		 401 aa  62.8  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000842595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  26.65 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  26.18 
 
 		 459 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  25.49 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  29.03 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  31.47 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1966  amidohydrolase  28.57 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  29.19 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  25.66 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  30.65 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  25.83 
 
 		 485 aa  59.7  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  23.94 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  26.36 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  31.71 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  27.98 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  25 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  24.59 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  24.21 
 
 		 443 aa  56.6  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  25.45 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  29.51 
 
 		 428 aa  56.2  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  26.26 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  27.66 
 
 		 426 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  26.13 
 
 		 418 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  23.81 
 
 		 672 aa  54.3  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  29.21 
 
 		 480 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  26.44 
 
 		 444 aa  54.7  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  25 
 
 		 428 aa  53.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2275  amidohydrolase  23.87 
 
 		 450 aa  52.8  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  25.19 
 
 		 437 aa  52.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>