193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2244 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2244  amidohydrolase  100 
 
 
367 aa  731    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.209508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1191  amidohydrolase  68.89 
 
 
359 aa  458  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251504  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1302  amidohydrolase  67.78 
 
 
359 aa  443  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1562  amidohydrolase 3  53.13 
 
 
362 aa  340  2e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345787  normal  0.0640888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5929  amidohydrolase  51.8 
 
 
356 aa  330  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117607  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4010  amidohydrolase  53.48 
 
 
361 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12929  hypothetical protein  49.31 
 
 
370 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0687  normal  0.519945 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09720  Pro-Hyp dipeptidase  51.8 
 
 
354 aa  310  2.9999999999999997e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.885607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2182  amidohydrolase  49.59 
 
 
360 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322343  normal  0.931322 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11020  amidohydrolase, imidazolonepropionase  46.26 
 
 
366 aa  291  1e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.161229  normal  0.0546284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1281  amidohydrolase  50.14 
 
 
364 aa  287  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1397  amidohydrolase  49.44 
 
 
359 aa  281  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  decreased coverage  0.00549847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4181  amidohydrolase  48.1 
 
 
362 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2226  amidohydrolase  46.74 
 
 
360 aa  278  8e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000139869 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2486  amidohydrolase  46.22 
 
 
360 aa  278  8e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445092  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1960  amidohydrolase  49.85 
 
 
368 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2006  amidohydrolase  49.85 
 
 
368 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0811412  normal  0.722686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1940  amidohydrolase  49.85 
 
 
368 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.864175 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1166  amidohydrolase  51.08 
 
 
373 aa  276  5e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3262  amidohydrolase  46.46 
 
 
361 aa  275  9e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23760  amidohydrolase, imidazolonepropionase  46.39 
 
 
378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3462  amidohydrolase 3  50 
 
 
365 aa  268  8.999999999999999e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09960  amidohydrolase, imidazolonepropionase  49.1 
 
 
388 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0916327  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1469  amidohydrolase  46.99 
 
 
362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.145414 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2082  amidohydrolase  43.06 
 
 
357 aa  243  5e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1612  amidohydrolase  43.11 
 
 
358 aa  236  6e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0569822  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3142  amidohydrolase  43.54 
 
 
359 aa  225  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000508689  normal  0.129698 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0984  amidohydrolase  40.18 
 
 
358 aa  202  8e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000713577  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  26.25 
 
 
407 aa  99.8  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3597  amidohydrolase  29.89 
 
 
445 aa  99  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  27.01 
 
 
433 aa  95.5  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  28.15 
 
 
440 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  26.42 
 
 
433 aa  94  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  27.22 
 
 
407 aa  93.2  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  25.83 
 
 
434 aa  92.8  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  25.82 
 
 
426 aa  91.3  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  27.38 
 
 
390 aa  92  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  27.27 
 
 
396 aa  91.3  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  26.7 
 
 
437 aa  89.4  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  25.34 
 
 
407 aa  89  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0462  amidohydrolase  29.86 
 
 
401 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000842595  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  27.09 
 
 
459 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  25.62 
 
 
444 aa  87.4  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  26.33 
 
 
413 aa  87  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  27.85 
 
 
423 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  27.3 
 
 
445 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  28.79 
 
 
438 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  25.63 
 
 
432 aa  83.6  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  26.82 
 
 
421 aa  83.6  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  29.51 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  27.42 
 
 
448 aa  82.4  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  25.96 
 
 
407 aa  82  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  27.25 
 
 
426 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  31.41 
 
 
422 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  27.08 
 
 
433 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  27.65 
 
 
440 aa  80.1  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2402  amidohydrolase  29.81 
 
 
397 aa  79.7  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  26.1 
 
 
426 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  25.21 
 
 
410 aa  79.3  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  26.68 
 
 
430 aa  79  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  32.7 
 
 
419 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  29.97 
 
 
408 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  27.61 
 
 
423 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  29.97 
 
 
408 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  29.97 
 
 
408 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  29.46 
 
 
421 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  23.1 
 
 
401 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  28.11 
 
 
426 aa  76.3  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  28.21 
 
 
423 aa  76.3  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  28.37 
 
 
402 aa  76.3  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  28.23 
 
 
447 aa  76.3  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  29.19 
 
 
447 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  30.43 
 
 
404 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  33.33 
 
 
421 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  32.46 
 
 
414 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  30.85 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  28.82 
 
 
412 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  24.16 
 
 
412 aa  72.8  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  28.37 
 
 
415 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  25.97 
 
 
428 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  25.33 
 
 
431 aa  72.4  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  25.52 
 
 
456 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  28.47 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  31.4 
 
 
417 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  31.4 
 
 
417 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  31.4 
 
 
417 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  26.72 
 
 
428 aa  70.5  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  26.33 
 
 
432 aa  70.9  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  25.55 
 
 
443 aa  70.5  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1571  amidohydrolase  28.43 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0206923  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  27.89 
 
 
403 aa  69.7  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  29.5 
 
 
418 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  32.5 
 
 
429 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  30.92 
 
 
424 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2941  amidohydrolase  24.84 
 
 
390 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.270763  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  32.02 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  32.02 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  32.02 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  26.94 
 
 
461 aa  67.4  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  25.32 
 
 
478 aa  66.6  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>