197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4010 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4010  amidohydrolase  100 
 
 		 361 aa  701    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5929  amidohydrolase  61.62 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117607  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12929  hypothetical protein  59.33 
 
 		 370 aa  393  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0687  normal  0.519945 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09720  Pro-Hyp dipeptidase  60 
 
 		 354 aa  381  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.885607 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11020  amidohydrolase, imidazolonepropionase  57.26 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.161229  normal  0.0546284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2182  amidohydrolase  58.47 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322343  normal  0.931322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3262  amidohydrolase  54.57 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1960  amidohydrolase  57.57 
 
 		 368 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2006  amidohydrolase  57.57 
 
 		 368 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0811412  normal  0.722686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1940  amidohydrolase  57.57 
 
 		 368 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.864175 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1397  amidohydrolase  60.5 
 
 		 359 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  decreased coverage  0.00549847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4181  amidohydrolase  60.71 
 
 		 362 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1562  amidohydrolase 3  54.42 
 
 		 362 aa  361  1e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345787  normal  0.0640888 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2486  amidohydrolase  54.37 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445092  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1191  amidohydrolase  56.74 
 
 		 359 aa  359  4e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251504  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2226  amidohydrolase  56.2 
 
 		 360 aa  356  3.9999999999999996e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000139869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1302  amidohydrolase  55.74 
 
 		 359 aa  353  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3462  amidohydrolase 3  58.15 
 
 		 365 aa  345  5e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2244  amidohydrolase  53.48 
 
 		 367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.209508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1281  amidohydrolase  54.12 
 
 		 364 aa  337  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23760  amidohydrolase, imidazolonepropionase  51.23 
 
 		 378 aa  331  1e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1612  amidohydrolase  52.37 
 
 		 358 aa  323  4e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0569822  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1469  amidohydrolase  53.5 
 
 		 362 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145414 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2082  amidohydrolase  51.98 
 
 		 357 aa  311  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1166  amidohydrolase  52.03 
 
 		 373 aa  306  3e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3142  amidohydrolase  53.87 
 
 		 359 aa  302  7.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000508689  normal  0.129698 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09960  amidohydrolase, imidazolonepropionase  50.69 
 
 		 388 aa  291  8e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0916327  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0984  amidohydrolase  47.06 
 
 		 358 aa  263  3e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000713577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  30.14 
 
 		 433 aa  97.1  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  30.41 
 
 		 440 aa  96.7  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  30.08 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  30.08 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  30.08 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  26.3 
 
 		 407 aa  92.8  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  29.17 
 
 		 430 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  27.47 
 
 		 445 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  34.06 
 
 		 421 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  29.19 
 
 		 423 aa  90.5  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  29.66 
 
 		 412 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  27.39 
 
 		 390 aa  90.1  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  30.08 
 
 		 411 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  28 
 
 		 396 aa  88.2  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  33.19 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  33.19 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  33.19 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  24.56 
 
 		 400 aa  87  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  26.38 
 
 		 407 aa  85.9  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  26.42 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  31.11 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  32.75 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  24.04 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  24.35 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  26.54 
 
 		 426 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  27.37 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  31.88 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3597  amidohydrolase  32.38 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  30.48 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  29.96 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  31.92 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  25.89 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2941  amidohydrolase  27.59 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.270763  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  26.4 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  25.71 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  30.33 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  28.87 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  28.37 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  31 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  24.31 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  26.21 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  27.47 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  31.52 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  27.53 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  26.18 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  24.94 
 
 		 447 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  29.47 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  30.49 
 
 		 440 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  26.67 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  26.21 
 
 		 432 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0462  amidohydrolase  29.91 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000842595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  28.73 
 
 		 429 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1966  amidohydrolase  32.93 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  25.99 
 
 		 444 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  28.41 
 
 		 415 aa  72  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  28.92 
 
 		 436 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  29.69 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2402  amidohydrolase  30.49 
 
 		 397 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18800  amidohydrolase, imidazolonepropionase  32.24 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0282711  normal  0.197659 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  25.65 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  30.88 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2674  amidohydrolase  33.62 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  28.41 
 
 		 447 aa  71.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  25.33 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  29.41 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  27.57 
 
 		 480 aa  70.1  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  28.86 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  28.33 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  25.49 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  25.28 
 
 		 431 aa  66.2  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  26.32 
 
 		 421 aa  66.2  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  24.72 
 
 		 431 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>