198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1166 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1166  amidohydrolase  100 
 
 
373 aa  715    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23760  amidohydrolase, imidazolonepropionase  65.18 
 
 
378 aa  431  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1469  amidohydrolase  63.06 
 
 
362 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.145414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5929  amidohydrolase  56.55 
 
 
356 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117607  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11020  amidohydrolase, imidazolonepropionase  51.52 
 
 
366 aa  352  5.9999999999999994e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.161229  normal  0.0546284 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12929  hypothetical protein  53.19 
 
 
370 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0687  normal  0.519945 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0984  amidohydrolase  52.37 
 
 
358 aa  330  3e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000713577  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1397  amidohydrolase  53.63 
 
 
359 aa  329  5.0000000000000004e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  decreased coverage  0.00549847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1281  amidohydrolase  54.29 
 
 
364 aa  328  9e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3462  amidohydrolase 3  53.41 
 
 
365 aa  326  5e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09720  Pro-Hyp dipeptidase  54.19 
 
 
354 aa  323  4e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.885607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2182  amidohydrolase  49.59 
 
 
360 aa  320  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322343  normal  0.931322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3262  amidohydrolase  48.77 
 
 
361 aa  319  5e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2226  amidohydrolase  48.76 
 
 
360 aa  318  1e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000139869 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09960  amidohydrolase, imidazolonepropionase  52.45 
 
 
388 aa  315  8e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0916327  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2486  amidohydrolase  49.16 
 
 
360 aa  312  4.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445092  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1960  amidohydrolase  50.68 
 
 
368 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1562  amidohydrolase 3  49.58 
 
 
362 aa  310  2e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345787  normal  0.0640888 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2006  amidohydrolase  50.68 
 
 
368 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0811412  normal  0.722686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1940  amidohydrolase  50.68 
 
 
368 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.864175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4010  amidohydrolase  52.03 
 
 
361 aa  299  7e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4181  amidohydrolase  49.18 
 
 
362 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1191  amidohydrolase  52.81 
 
 
359 aa  283  5.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251504  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1612  amidohydrolase  45.83 
 
 
358 aa  280  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0569822  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2244  amidohydrolase  51.08 
 
 
367 aa  276  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.209508 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1302  amidohydrolase  52.19 
 
 
359 aa  276  5e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2082  amidohydrolase  49.05 
 
 
357 aa  268  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3142  amidohydrolase  49.54 
 
 
359 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000508689  normal  0.129698 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  29.17 
 
 
390 aa  94  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  28.93 
 
 
396 aa  91.7  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  27.37 
 
 
407 aa  90.9  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  28.9 
 
 
415 aa  89.4  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  28.15 
 
 
433 aa  89.4  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0462  amidohydrolase  31.36 
 
 
401 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000842595  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  29.61 
 
 
433 aa  88.6  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  28.49 
 
 
423 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  30.88 
 
 
391 aa  87  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  25.76 
 
 
407 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  30.14 
 
 
421 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  30.2 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  30.2 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  30.2 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  29.13 
 
 
440 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  26.21 
 
 
407 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  26.26 
 
 
434 aa  82  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  25.98 
 
 
426 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  26.91 
 
 
459 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  28.77 
 
 
443 aa  80.9  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  27.32 
 
 
430 aa  80.5  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  26.4 
 
 
432 aa  80.1  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  29.23 
 
 
423 aa  80.1  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  28.13 
 
 
433 aa  79  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  27.17 
 
 
423 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  27.58 
 
 
438 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  24.86 
 
 
426 aa  77.8  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3597  amidohydrolase  31.23 
 
 
445 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  28.35 
 
 
426 aa  77  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2941  amidohydrolase  28.57 
 
 
390 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.270763  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  26.69 
 
 
432 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  25.47 
 
 
413 aa  76.3  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  26.42 
 
 
409 aa  75.5  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  27.51 
 
 
444 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  26.12 
 
 
437 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  27.25 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  24.11 
 
 
401 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  28.74 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  28.63 
 
 
411 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  36.78 
 
 
422 aa  73.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  24.16 
 
 
431 aa  72.8  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  34.12 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  25.78 
 
 
445 aa  70.5  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  30.75 
 
 
418 aa  70.5  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  23.76 
 
 
441 aa  70.5  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  26.9 
 
 
440 aa  70.1  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  23.7 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  29.79 
 
 
455 aa  69.7  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  25.07 
 
 
411 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  24.66 
 
 
410 aa  69.3  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  27.14 
 
 
421 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3221  amidohydrolase  27.75 
 
 
413 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000000027233  hitchhiker  0.000156349 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  23.88 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  25.98 
 
 
438 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  26.32 
 
 
447 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  23.44 
 
 
411 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  25.56 
 
 
445 aa  66.6  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  27.42 
 
 
702 aa  66.6  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  30.04 
 
 
428 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  28.4 
 
 
414 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2674  amidohydrolase  32.81 
 
 
394 aa  63.5  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  26.94 
 
 
412 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  27.05 
 
 
478 aa  63.5  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  28.25 
 
 
511 aa  63.9  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  28.03 
 
 
428 aa  63.5  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  27.86 
 
 
425 aa  63.2  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10074  hypothetical protein  30.65 
 
 
411 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0244263 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18800  amidohydrolase, imidazolonepropionase  31.81 
 
 
416 aa  63.2  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0282711  normal  0.197659 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2402  amidohydrolase  28.49 
 
 
397 aa  63.2  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  27.51 
 
 
404 aa  62.8  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3738  amidohydrolase  28.36 
 
 
432 aa  62.8  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185832  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  24.53 
 
 
672 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>