245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2402 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2402  amidohydrolase  100 
 
 		 397 aa  801    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1571  amidohydrolase  47.09 
 
 		 392 aa  312  7.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0206923  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0462  amidohydrolase  33.91 
 
 		 401 aa  186  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000842595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4333  amidohydrolase  33.17 
 
 		 424 aa  169  8e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.48776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  28.16 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2941  amidohydrolase  30.84 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.270763  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  30.71 
 
 		 430 aa  126  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  32.75 
 
 		 391 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  30.57 
 
 		 423 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  31.39 
 
 		 421 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  31.25 
 
 		 459 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  30.03 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  30.26 
 
 		 426 aa  110  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  28.95 
 
 		 445 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  28.34 
 
 		 401 aa  110  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  30.63 
 
 		 440 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  31.47 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  29.06 
 
 		 433 aa  107  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  29.44 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  28.74 
 
 		 400 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  28.53 
 
 		 433 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  28.64 
 
 		 437 aa  103  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  26.85 
 
 		 440 aa  102  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  27.49 
 
 		 470 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  25.47 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  28.49 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  26.46 
 
 		 413 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  27.9 
 
 		 426 aa  99.8  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  29.72 
 
 		 438 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  31.36 
 
 		 409 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  30.67 
 
 		 432 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  31.36 
 
 		 409 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  26.96 
 
 		 415 aa  98.6  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  26.6 
 
 		 568 aa  97.8  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  31.11 
 
 		 409 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  26.49 
 
 		 423 aa  96.3  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0293  amidohydrolase  26.68 
 
 		 415 aa  96.3  9e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.356604 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  27.96 
 
 		 421 aa  95.5  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  29.33 
 
 		 423 aa  94.4  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  30.46 
 
 		 405 aa  94  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5929  amidohydrolase  30.29 
 
 		 356 aa  93.2  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117607  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  29.14 
 
 		 422 aa  93.2  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  26.7 
 
 		 434 aa  92  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  29.38 
 
 		 428 aa  92.8  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  29.28 
 
 		 414 aa  90.1  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  33.05 
 
 		 429 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  34.83 
 
 		 419 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  26.8 
 
 		 407 aa  89.7  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  27.88 
 
 		 444 aa  89.7  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  24.88 
 
 		 407 aa  88.2  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  26.91 
 
 		 409 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  29.26 
 
 		 422 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  28.82 
 
 		 444 aa  87.8  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  28.5 
 
 		 419 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  28.25 
 
 		 419 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  33.33 
 
 		 421 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  27.92 
 
 		 433 aa  86.7  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  26.73 
 
 		 445 aa  86.3  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  25.9 
 
 		 428 aa  86.3  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  29.48 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  24.31 
 
 		 585 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  26.33 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  28.25 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  33.15 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  31.87 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  31.87 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  31.87 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  27.27 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  24.56 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  32.58 
 
 		 424 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  26.72 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  26.74 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1966  amidohydrolase  33.56 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  25.88 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  28.04 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  27.1 
 
 		 426 aa  79.7  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  27.18 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  26.45 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  27.32 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  31.96 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  24.94 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  25.87 
 
 		 441 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  29.04 
 
 		 418 aa  76.6  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2244  amidohydrolase  29.81 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.209508 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  27.52 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  27.68 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  27.38 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  29.95 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4704  amidohydrolase  25.75 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  27.37 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3597  amidohydrolase  30.35 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  26.53 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  26.37 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  28.82 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  23.88 
 
 		 483 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  26.6 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1562  amidohydrolase 3  33.5 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345787  normal  0.0640888 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  27.04 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  31.75 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  31.75 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>