206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1571 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1571  amidohydrolase  100 
 
 		 392 aa  800    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0206923  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2402  amidohydrolase  47.09 
 
 		 397 aa  303  4.0000000000000003e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4333  amidohydrolase  34.55 
 
 		 424 aa  173  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.48776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0462  amidohydrolase  34.62 
 
 		 401 aa  164  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000842595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  30.46 
 
 		 407 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  34.13 
 
 		 391 aa  129  6e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2941  amidohydrolase  30.06 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.270763  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  32.68 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  30.29 
 
 		 426 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  29.46 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  30.85 
 
 		 455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  30.03 
 
 		 407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  29.62 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  31.49 
 
 		 421 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  27.54 
 
 		 426 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  29.72 
 
 		 440 aa  106  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  29.01 
 
 		 413 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  29.1 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  31.23 
 
 		 423 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  29.44 
 
 		 444 aa  102  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  29.16 
 
 		 426 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  27.49 
 
 		 428 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  29.06 
 
 		 431 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  28.38 
 
 		 437 aa  100  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  29.05 
 
 		 444 aa  99  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  28.82 
 
 		 428 aa  97.8  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  28.36 
 
 		 470 aa  97.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  33.33 
 
 		 433 aa  97.1  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  28.42 
 
 		 423 aa  97.1  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  31.06 
 
 		 438 aa  96.7  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  29.39 
 
 		 401 aa  96.3  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  26.59 
 
 		 440 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  32.72 
 
 		 422 aa  94.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  28 
 
 		 433 aa  94.4  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  28.26 
 
 		 459 aa  94  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4704  amidohydrolase  29.84 
 
 		 424 aa  93.6  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  27.49 
 
 		 445 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  26.85 
 
 		 416 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  29.3 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  29.49 
 
 		 448 aa  88.2  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  28.05 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  29.06 
 
 		 426 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  29.74 
 
 		 432 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  27.63 
 
 		 434 aa  87.4  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  23.75 
 
 		 432 aa  87  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  29.18 
 
 		 421 aa  87  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  29.05 
 
 		 421 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  28.12 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  27.88 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  28.12 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  27.88 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  28.12 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  27.88 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  33.33 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  27.88 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  29.53 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  28.96 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  29.03 
 
 		 429 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  27.45 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  26.4 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  26.36 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  29.01 
 
 		 411 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  26.59 
 
 		 403 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  29.46 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  29.64 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  28.37 
 
 		 480 aa  82  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  31.11 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  28.94 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4905  amidohydrolase  31.43 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  31.11 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  31.11 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  28.14 
 
 		 423 aa  79.7  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2486  amidohydrolase  28.53 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445092  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  28.87 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  23.85 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1522  amidohydrolase  29.69 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0533658 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  28.66 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  26.22 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  27.64 
 
 		 412 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  28.87 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  24.59 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5929  amidohydrolase  28.53 
 
 		 356 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117607  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  27.44 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  28.66 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  28.66 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  27.61 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  28.08 
 
 		 402 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  27.6 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0275  amidohydrolase  27.03 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362841 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  25 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3221  amidohydrolase  28.15 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000000027233  hitchhiker  0.000156349 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  27.61 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2275  amidohydrolase  26.18 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2674  amidohydrolase  32.75 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  23.24 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  26.8 
 
 		 422 aa  72.8  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  28.67 
 
 		 461 aa  72.8  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  24.44 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  26.2 
 
 		 456 aa  72.4  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5063  amidohydrolase  33.24 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.655587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>