123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0984 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0984  amidohydrolase  100 
 
 		 358 aa  719    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000713577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23760  amidohydrolase, imidazolonepropionase  52.84 
 
 		 378 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1469  amidohydrolase  54.13 
 
 		 362 aa  323  3e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145414 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1166  amidohydrolase  52.37 
 
 		 373 aa  321  9.999999999999999e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2486  amidohydrolase  46.72 
 
 		 360 aa  289  6e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445092  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5929  amidohydrolase  48.04 
 
 		 356 aa  285  9e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117607  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11020  amidohydrolase, imidazolonepropionase  44.99 
 
 		 366 aa  283  2.0000000000000002e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.161229  normal  0.0546284 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2226  amidohydrolase  46.69 
 
 		 360 aa  283  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000139869 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12929  hypothetical protein  48.21 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0687  normal  0.519945 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1397  amidohydrolase  43.87 
 
 		 359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  decreased coverage  0.00549847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1281  amidohydrolase  46.74 
 
 		 364 aa  269  5e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1562  amidohydrolase 3  46.82 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345787  normal  0.0640888 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09720  Pro-Hyp dipeptidase  46.51 
 
 		 354 aa  265  8e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.885607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2182  amidohydrolase  47.65 
 
 		 360 aa  263  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322343  normal  0.931322 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2082  amidohydrolase  47.02 
 
 		 357 aa  258  9e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3462  amidohydrolase 3  44.69 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1960  amidohydrolase  46.79 
 
 		 368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2006  amidohydrolase  46.79 
 
 		 368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0811412  normal  0.722686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1940  amidohydrolase  46.79 
 
 		 368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.864175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4010  amidohydrolase  47.06 
 
 		 361 aa  253  5.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3262  amidohydrolase  41.4 
 
 		 361 aa  243  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09960  amidohydrolase, imidazolonepropionase  42.82 
 
 		 388 aa  235  7e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0916327  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4181  amidohydrolase  45.16 
 
 		 362 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1612  amidohydrolase  43.33 
 
 		 358 aa  228  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0569822  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3142  amidohydrolase  45.22 
 
 		 359 aa  227  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000508689  normal  0.129698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1191  amidohydrolase  41.91 
 
 		 359 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251504  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1302  amidohydrolase  41.33 
 
 		 359 aa  203  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2244  amidohydrolase  40.49 
 
 		 367 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.209508 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2674  amidohydrolase  32.46 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2941  amidohydrolase  26.75 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.270763  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  25.87 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  24.47 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  27.75 
 
 		 440 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  23.54 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18800  amidohydrolase, imidazolonepropionase  30.66 
 
 		 416 aa  76.3  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0282711  normal  0.197659 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  27.1 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  25.8 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0462  amidohydrolase  28.81 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000842595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3221  amidohydrolase  25.8 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000000027233  hitchhiker  0.000156349 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  28.53 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  25.45 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  23.48 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  24.64 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1522  amidohydrolase  31.41 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0533658 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  23.94 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  23.1 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  21.73 
 
 		 400 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  26.88 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  24.06 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  31.19 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  31.19 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  31.19 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  24.49 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  24.43 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  24.49 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  26 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  25.37 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  29.07 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4333  amidohydrolase  26.45 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.48776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  24.74 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  27.47 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  22.29 
 
 		 413 aa  62.8  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  24.86 
 
 		 433 aa  62  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  26.58 
 
 		 455 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  28.9 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  29.36 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1571  amidohydrolase  27.18 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0206923  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  26.49 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  27.25 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  27.9 
 
 		 459 aa  59.7  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4704  amidohydrolase  25.95 
 
 		 424 aa  59.7  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  23.19 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2275  amidohydrolase  24.73 
 
 		 450 aa  57  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  30.49 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  23.1 
 
 		 445 aa  56.6  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  22.19 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  25 
 
 		 423 aa  55.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  24.93 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  24.38 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  23.6 
 
 		 429 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3491  Pro-Hyp dipeptidase  22.52 
 
 		 426 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  24.29 
 
 		 432 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  29.71 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  24.6 
 
 		 414 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  23.95 
 
 		 423 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10074  hypothetical protein  25.39 
 
 		 411 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0244263 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  25.08 
 
 		 440 aa  53.1  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  27.42 
 
 		 403 aa  53.1  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  22.94 
 
 		 437 aa  52.8  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2402  amidohydrolase  26.91 
 
 		 397 aa  52.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  25.98 
 
 		 444 aa  53.1  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  26.73 
 
 		 421 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  26.39 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  26.39 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  26.39 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  26.02 
 
 		 422 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  24.28 
 
 		 406 aa  50.4  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  23.01 
 
 		 433 aa  49.7  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  22.03 
 
 		 431 aa  49.3  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  22.94 
 
 		 432 aa  49.7  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>