212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18800 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_18800  amidohydrolase, imidazolonepropionase  100 
 
 		 416 aa  797    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0282711  normal  0.197659 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  37.7 
 
 		 422 aa  193  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2992  amidohydrolase  41.44 
 
 		 489 aa  182  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  32.76 
 
 		 407 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  32.08 
 
 		 440 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  29.17 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  30.68 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  32.49 
 
 		 417 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  29.17 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  31.81 
 
 		 423 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  29.49 
 
 		 400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  31.07 
 
 		 431 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  31.25 
 
 		 459 aa  130  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  31.79 
 
 		 426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  29.71 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  26.42 
 
 		 413 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  32.43 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  30.67 
 
 		 419 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  31.91 
 
 		 430 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  29.41 
 
 		 426 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  31.04 
 
 		 419 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  30.65 
 
 		 413 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  31.08 
 
 		 433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  29.7 
 
 		 407 aa  119  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  30.21 
 
 		 413 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  27.13 
 
 		 434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  31.18 
 
 		 436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  28.45 
 
 		 445 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  28.12 
 
 		 426 aa  117  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  26.91 
 
 		 407 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  29.78 
 
 		 420 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  28.87 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  29.81 
 
 		 444 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  30.96 
 
 		 433 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  30.92 
 
 		 391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  28.7 
 
 		 425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  28 
 
 		 433 aa  113  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  30.06 
 
 		 441 aa  113  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  33.24 
 
 		 409 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  33.24 
 
 		 409 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  33.24 
 
 		 409 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  28.47 
 
 		 443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  30.15 
 
 		 405 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  26.67 
 
 		 437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  29.71 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  26.29 
 
 		 401 aa  111  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  29.89 
 
 		 438 aa  111  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  29.2 
 
 		 447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  29.28 
 
 		 426 aa  109  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  27.4 
 
 		 411 aa  109  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  29.07 
 
 		 416 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  29.78 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  29.49 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  29.02 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  29.25 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  28.05 
 
 		 430 aa  107  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  31.11 
 
 		 403 aa  106  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  29.94 
 
 		 412 aa  106  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  30.8 
 
 		 428 aa  106  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  28.31 
 
 		 461 aa  106  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  29.12 
 
 		 432 aa  106  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  30.67 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  28.17 
 
 		 431 aa  104  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  29.44 
 
 		 478 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  28.2 
 
 		 410 aa  104  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  30.83 
 
 		 415 aa  103  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  30.4 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  32.35 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  28.65 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0462  amidohydrolase  31.22 
 
 		 401 aa  101  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000842595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  28.29 
 
 		 405 aa  101  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  28.61 
 
 		 423 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  28.38 
 
 		 428 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  31.97 
 
 		 408 aa  99.8  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  26.03 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  26.03 
 
 		 412 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  25.81 
 
 		 408 aa  98.6  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  27.2 
 
 		 405 aa  97.4  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  28.96 
 
 		 411 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  28.19 
 
 		 411 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  28.11 
 
 		 413 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  27.19 
 
 		 409 aa  95.9  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  26.99 
 
 		 411 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2226  amidohydrolase  33.33 
 
 		 360 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000139869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  29.6 
 
 		 408 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  29.6 
 
 		 408 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  28.53 
 
 		 412 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  29.6 
 
 		 408 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  28.61 
 
 		 444 aa  94.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  26.61 
 
 		 456 aa  94  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  31.82 
 
 		 421 aa  93.6  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  28 
 
 		 414 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  28.08 
 
 		 409 aa  92.8  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  27.25 
 
 		 431 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  28.61 
 
 		 426 aa  92  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  28.35 
 
 		 409 aa  91.3  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  28.23 
 
 		 434 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  28 
 
 		 438 aa  90.5  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  28.96 
 
 		 421 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4333  amidohydrolase  29.47 
 
 		 424 aa  89  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.48776  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>