222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2992 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2992  amidohydrolase  100 
 
 		 489 aa  939    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  51.09 
 
 		 422 aa  333  4e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18800  amidohydrolase, imidazolonepropionase  41.44 
 
 		 416 aa  204  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0282711  normal  0.197659 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  33.65 
 
 		 407 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  34.03 
 
 		 411 aa  155  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  31.5 
 
 		 426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  39.14 
 
 		 409 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  39.14 
 
 		 409 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  39.14 
 
 		 409 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  33.25 
 
 		 443 aa  150  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  33.17 
 
 		 405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  33.52 
 
 		 440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  32.55 
 
 		 445 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  33.49 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  34.43 
 
 		 436 aa  144  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  31.78 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  34.05 
 
 		 423 aa  141  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  33.68 
 
 		 413 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  34.03 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  33.68 
 
 		 413 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  32.67 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  29.41 
 
 		 407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  32.66 
 
 		 408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  28.46 
 
 		 426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  31.48 
 
 		 431 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  31.96 
 
 		 405 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  31.9 
 
 		 426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  32.68 
 
 		 411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  32.93 
 
 		 411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  32.89 
 
 		 413 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  33.71 
 
 		 433 aa  134  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  31.93 
 
 		 420 aa  133  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  31.42 
 
 		 421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  31.23 
 
 		 455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  35.05 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  34.34 
 
 		 415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  33.8 
 
 		 411 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  27.38 
 
 		 407 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  33.42 
 
 		 405 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  32.52 
 
 		 419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  33.82 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  32.68 
 
 		 419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  33.68 
 
 		 426 aa  127  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  34.77 
 
 		 423 aa  128  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  33.42 
 
 		 461 aa  127  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  34.08 
 
 		 425 aa  127  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  34.1 
 
 		 428 aa  127  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  33.07 
 
 		 459 aa  127  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  33.07 
 
 		 433 aa  126  7e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  29.86 
 
 		 445 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  34.1 
 
 		 403 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  34.99 
 
 		 408 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  34.45 
 
 		 409 aa  124  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  31.93 
 
 		 414 aa  123  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  29.33 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  34.21 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  30.05 
 
 		 480 aa  121  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  32.12 
 
 		 415 aa  121  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  27.49 
 
 		 400 aa  120  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  31.52 
 
 		 423 aa  119  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  31.66 
 
 		 456 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  29.46 
 
 		 444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  28.29 
 
 		 444 aa  117  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  29.7 
 
 		 406 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  28.45 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  29.17 
 
 		 407 aa  115  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  29.74 
 
 		 421 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  32.35 
 
 		 438 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  28.73 
 
 		 412 aa  114  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  33.7 
 
 		 425 aa  114  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  31.44 
 
 		 402 aa  113  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  29.3 
 
 		 433 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  31.65 
 
 		 447 aa  113  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  29.6 
 
 		 437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  29.78 
 
 		 461 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  30.34 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  29.21 
 
 		 434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  29.33 
 
 		 430 aa  111  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  33.06 
 
 		 414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  26.15 
 
 		 451 aa  110  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  30.99 
 
 		 447 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  32.1 
 
 		 422 aa  109  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  28.86 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  27.75 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  30.55 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  29.72 
 
 		 418 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  28.16 
 
 		 413 aa  106  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  29.27 
 
 		 434 aa  106  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  28.18 
 
 		 396 aa  106  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  28.89 
 
 		 409 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  27.37 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  31.2 
 
 		 424 aa  104  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  31.14 
 
 		 428 aa  103  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02779  conserved hypothetical protein  27.17 
 
 		 493 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.243832  normal  0.291851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  31.53 
 
 		 429 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  29.56 
 
 		 470 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  26.38 
 
 		 429 aa  99.8  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  32.07 
 
 		 419 aa  99.8  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  31.35 
 
 		 413 aa  100  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  28.5 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>