More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3517 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3517  peptidase S41  100 
 
 		 432 aa  872    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0636352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2615  peptidase S41  28.43 
 
 		 427 aa  117  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  26.55 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3812  peptidase S41  25.67 
 
 		 444 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205907  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  24.63 
 
 		 465 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  25.69 
 
 		 457 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  28.87 
 
 		 483 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  27.03 
 
 		 482 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  28.5 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35170  C-terminal peptidase, S41A subfamily  24.73 
 
 		 693 aa  73.6  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.422257  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  31.15 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2146  C-terminal processing peptidase-1  25.71 
 
 		 712 aa  73.2  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.19614 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1519  C-terminal processing peptidase-1  26.18 
 
 		 698 aa  71.6  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  25.21 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0662  carboxyl-terminal protease  27.57 
 
 		 547 aa  70.1  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1993  carboxy-terminal protease  31.29 
 
 		 679 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000930411  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1071  carboxy-terminal protease  23.8 
 
 		 675 aa  68.9  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.461658  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1321  carboxyl-terminal protease  25.14 
 
 		 704 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21880  periplasmic tail-specific protease  23.61 
 
 		 698 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0932853  hitchhiker  0.00000629787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1868  periplasmic tail-specific protease  23.61 
 
 		 699 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.435516  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2119  carboxy-terminal protease  25.35 
 
 		 678 aa  67.8  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000159277  hitchhiker  0.000525254 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2074  carboxy-terminal protease  24.86 
 
 		 673 aa  67.4  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2810  carboxy-terminal protease  31.51 
 
 		 683 aa  67.4  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0215017  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02002  carboxy-terminal protease  23.96 
 
 		 680 aa  67.4  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373627  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2483  carboxy-terminal protease  24.93 
 
 		 690 aa  67  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000106803  normal  0.0256948 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2187  carboxy-terminal protease  24.86 
 
 		 664 aa  67  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.596133  normal  0.445771 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2663  carboxy-terminal protease  26.04 
 
 		 689 aa  66.6  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000297932  hitchhiker  0.0063771 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1935  carboxy-terminal protease  25.27 
 
 		 681 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.487036  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02346  carboxy-terminal protease  23.96 
 
 		 664 aa  66.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1104  carboxy-terminal protease  24.79 
 
 		 665 aa  66.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153479  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1672  carboxy-terminal protease  25.48 
 
 		 690 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000704013  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1783  carboxy-terminal protease  25.48 
 
 		 692 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00680502  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  30.28 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1853  carboxy-terminal protease  25.68 
 
 		 671 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.535922  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4863  Periplasmic protease-like protein  29.83 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  23.81 
 
 		 566 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2141  carboxy-terminal protease  25.96 
 
 		 671 aa  65.5  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  33.56 
 
 		 710 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1802  carboxy-terminal protease  24.66 
 
 		 681 aa  65.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.308146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1845  carboxy-terminal protease  25.44 
 
 		 673 aa  64.7  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6521  carboxyl-terminal protease  22.87 
 
 		 709 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0166  carboxyl-terminal protease  25.69 
 
 		 726 aa  64.3  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2133  carboxy-terminal protease  24.45 
 
 		 690 aa  64.3  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000755516  normal  0.0766103 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0351  peptidase S41  26.4 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1046  carboxyl-terminal protease  23.39 
 
 		 693 aa  64.3  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000142201  unclonable  0.00000192026 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0632  C-terminal processing peptidase-1  29.89 
 
 		 705 aa  63.9  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.366246 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1328  C-terminal processing peptidase-1  23.12 
 
 		 694 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0242336  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003431  tail-specific protease precursor  22.91 
 
 		 668 aa  62.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00461835  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1722  carboxy-terminal protease  24.73 
 
 		 683 aa  62.4  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000352033  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2491  carboxyl-terminal protease  23.86 
 
 		 721 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  28.64 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0315  carboxyl-terminal protease  27.34 
 
 		 735 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144056  hitchhiker  0.0000288236 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1161  peptidase S41  27.65 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.724073  decreased coverage  0.00200018 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5898  carboxyl-terminal protease  24.79 
 
 		 705 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2272  peptidase S41  29.65 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0309  carboxyl-terminal protease  28.78 
 
 		 737 aa  61.6  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0982282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  19.84 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  30.35 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0282  C-terminal processing peptidase-1  28.78 
 
 		 737 aa  60.8  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  28.65 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1357  carboxy-terminal protease  29.19 
 
 		 680 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000834708  normal  0.174046 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1106  carboxyl-terminal protease  32.21 
 
 		 727 aa  60.5  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1585  carboxy-terminal protease  24.86 
 
 		 681 aa  60.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00663256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1200  C-terminal processing peptidase  32.21 
 
 		 727 aa  60.8  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2601  carboxy-terminal protease  24.11 
 
 		 682 aa  60.5  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  25.97 
 
 		 569 aa  60.1  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2228  carboxy-terminal protease  24.93 
 
 		 683 aa  60.5  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.128038  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5403  carboxyl-terminal protease  26.7 
 
 		 705 aa  60.1  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0582  carboxyl-terminal protease  30.29 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000258351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  30.35 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  24.72 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1812  carboxyl-terminal protease  29.19 
 
 		 682 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412935  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1921  carboxy-terminal protease  29.19 
 
 		 682 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149225  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2563  carboxy-terminal protease  29.19 
 
 		 680 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000036056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1994  C-terminal processing peptidase-1  25.14 
 
 		 703 aa  59.7  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.754178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1802  carboxy-terminal protease  29.19 
 
 		 682 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0594829 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0121  carboxyl-terminal protease  26.27 
 
 		 706 aa  59.7  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01801  carboxy-terminal protease for penicillin-binding protein 3  29.19 
 
 		 682 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04840  probable periplasmic tail-specific proteinase  27.33 
 
 		 706 aa  59.3  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  26.6 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  20.93 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2822  peptidase S41  28.78 
 
 		 314 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  33.09 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1988  carboxy-terminal protease  28.57 
 
 		 698 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.547675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01789  hypothetical protein  29.19 
 
 		 682 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  26.46 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2059  carboxy-terminal protease  29.19 
 
 		 682 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028938  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2098  carboxy-terminal protease  29.19 
 
 		 682 aa  59.7  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000592203  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2046  carboxy-terminal protease  28.57 
 
 		 682 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1904  carboxy-terminal protease  24.11 
 
 		 681 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.239407  normal  0.209201 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1286  carboxy-terminal protease  28.57 
 
 		 682 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000018564  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  23.76 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2560  carboxy-terminal protease  24.11 
 
 		 681 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.21905  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2400  carboxy-terminal protease  29.19 
 
 		 682 aa  58.9  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1479  carboxyl-terminal protease  33.12 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1470  carboxy-terminal protease  28.57 
 
 		 682 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0690257  normal  0.257685 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1984  carboxy-terminal protease  28.57 
 
 		 682 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00711922  hitchhiker  0.00523275 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1354  peptidase S41  33.12 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.405316  normal  0.73839 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1599  peptidase S41A, C-terminal protease  22.53 
 
 		 704 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0464892 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  24.53 
 
 		 1193 aa  58.2  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>