53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3217 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  100 
 
 
682 aa  1394    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  37.69 
 
 
656 aa  357  3.9999999999999996e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  34.63 
 
 
647 aa  342  2e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  34.22 
 
 
656 aa  334  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  32.24 
 
 
678 aa  331  3e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  33.89 
 
 
648 aa  316  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  30.04 
 
 
659 aa  312  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  33.38 
 
 
655 aa  303  9e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  31.61 
 
 
679 aa  302  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  32.5 
 
 
701 aa  291  3e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  31.65 
 
 
677 aa  290  9e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  34.25 
 
 
703 aa  286  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  31.96 
 
 
684 aa  286  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  32.86 
 
 
693 aa  285  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  30.71 
 
 
672 aa  283  5.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  29.88 
 
 
673 aa  281  4e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  31.8 
 
 
727 aa  267  5e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  29.97 
 
 
707 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  29.93 
 
 
629 aa  264  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  30.75 
 
 
703 aa  263  6e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  30.46 
 
 
703 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  30.29 
 
 
710 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  30.69 
 
 
702 aa  261  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  30.7 
 
 
710 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  30.6 
 
 
703 aa  260  7e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  31.73 
 
 
676 aa  259  8e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  30.7 
 
 
710 aa  259  9e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  27.88 
 
 
726 aa  257  5e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  28.81 
 
 
704 aa  256  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  28.1 
 
 
727 aa  255  2.0000000000000002e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  29.12 
 
 
697 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  31 
 
 
683 aa  254  4.0000000000000004e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  30.24 
 
 
606 aa  253  7e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  28.79 
 
 
707 aa  248  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  29.31 
 
 
680 aa  248  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  30.4 
 
 
699 aa  248  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  28.57 
 
 
711 aa  240  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  27.86 
 
 
682 aa  236  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  27.59 
 
 
728 aa  231  3e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  30.22 
 
 
643 aa  229  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  30.6 
 
 
574 aa  227  5.0000000000000005e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  26.9 
 
 
700 aa  226  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  28.31 
 
 
674 aa  224  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  30.16 
 
 
571 aa  217  5.9999999999999996e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  27.65 
 
 
649 aa  208  2e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  26.56 
 
 
615 aa  197  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  26.9 
 
 
641 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  26.56 
 
 
661 aa  187  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  27.57 
 
 
658 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  26.95 
 
 
630 aa  174  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  25.97 
 
 
648 aa  171  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  27.94 
 
 
1255 aa  157  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  24.72 
 
 
647 aa  148  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>