More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2672 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2672  major facilitator transporter  100 
 
 		 433 aa  864    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3474  major facilitator superfamily MFS_1  38.13 
 
 		 415 aa  268  8.999999999999999e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00256717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  35.95 
 
 		 430 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  35.97 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.25 
 
 		 460 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 460 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 		 426 aa  230  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 434 aa  227  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  34.89 
 
 		 433 aa  226  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  35.18 
 
 		 433 aa  223  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  35.84 
 
 		 433 aa  223  7e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  36.74 
 
 		 448 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 435 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  35.34 
 
 		 433 aa  221  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4099  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.1 
 
 		 433 aa  216  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  35.75 
 
 		 429 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  36.83 
 
 		 429 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 		 435 aa  213  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  34.52 
 
 		 455 aa  212  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 430 aa  209  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 429 aa  209  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  35.31 
 
 		 451 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 439 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 440 aa  202  9e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2069  major facilitator superfamily protein  28.23 
 
 		 424 aa  199  5e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118592  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2587  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2535  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  31.63 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 427 aa  193  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 428 aa  190  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  31.03 
 
 		 446 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 446 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 442 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 423 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 423 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 428 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 437 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  31.23 
 
 		 449 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  29.16 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4215  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 438 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.528706 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  30.27 
 
 		 428 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  30.27 
 
 		 428 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  30.27 
 
 		 428 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  30.27 
 
 		 428 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.6 
 
 		 437 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  30.02 
 
 		 428 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 426 aa  176  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0068  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 447 aa  175  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 428 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 440 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 440 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  29.76 
 
 		 450 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5075  major facilitator transporter  31.64 
 
 		 430 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  30.34 
 
 		 436 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 		 453 aa  170  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 436 aa  170  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 425 aa  170  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  29.71 
 
 		 436 aa  169  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 430 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  29.52 
 
 		 450 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 436 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 461 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  33.49 
 
 		 454 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  33.49 
 
 		 454 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 436 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 436 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 430 aa  167  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 436 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 438 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  30.34 
 
 		 451 aa  166  5.9999999999999996e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2612  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 433 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209857  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  29.73 
 
 		 458 aa  166  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  31.06 
 
 		 450 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  30.84 
 
 		 450 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 422 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  28.44 
 
 		 429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3397  D-galactonate transporter  30.25 
 
 		 446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  31.06 
 
 		 450 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  31.06 
 
 		 450 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  31.06 
 
 		 450 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  31.06 
 
 		 450 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  30.82 
 
 		 440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  31.06 
 
 		 450 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  27.8 
 
 		 461 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  31.21 
 
 		 451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 436 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 431 aa  164  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  30.84 
 
 		 450 aa  164  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 454 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 449 aa  164  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 463 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  33.25 
 
 		 454 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>