More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1984 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1984  ABC transporter related  100 
 
 		 605 aa  1204    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2782  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.8 
 
 		 596 aa  456  1e-127  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0170515  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1304  ABC transporter related  38.26 
 
 		 602 aa  445  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1769  ABC transporter related  38.54 
 
 		 614 aa  437  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0624657  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19290  ABC transporter related  49.85 
 
 		 329 aa  368  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.715908  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  34.28 
 
 		 586 aa  336  9e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  36.17 
 
 		 588 aa  333  5e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  34.55 
 
 		 587 aa  326  9e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  32.21 
 
 		 578 aa  324  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  32.21 
 
 		 578 aa  324  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  36.6 
 
 		 583 aa  323  7e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  33.87 
 
 		 586 aa  318  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  36.23 
 
 		 591 aa  318  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  35.62 
 
 		 604 aa  317  4e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  33.65 
 
 		 581 aa  316  6e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  35.17 
 
 		 600 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1941  ABC transporter, transmembrane region  35.54 
 
 		 592 aa  313  4.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.121107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  33.77 
 
 		 584 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  37.56 
 
 		 601 aa  313  6.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  33.52 
 
 		 583 aa  312  1e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  34.18 
 
 		 591 aa  312  1e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  34.04 
 
 		 585 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  36.8 
 
 		 589 aa  310  6.999999999999999e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.08 
 
 		 578 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  31.78 
 
 		 594 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  32.6 
 
 		 587 aa  307  3e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  38.66 
 
 		 606 aa  306  6e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  31.15 
 
 		 596 aa  306  6e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.94 
 
 		 571 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4932  cyclic nucleotide-binding protein  38.05 
 
 		 590 aa  306  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.074609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  35.36 
 
 		 579 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.94 
 
 		 571 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4484  ABC transporter related  34.49 
 
 		 581 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  31.1 
 
 		 585 aa  304  3.0000000000000004e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  31.05 
 
 		 592 aa  304  3.0000000000000004e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.76 
 
 		 571 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.76 
 
 		 571 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  34.52 
 
 		 572 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.76 
 
 		 571 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.76 
 
 		 571 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.76 
 
 		 571 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  32.06 
 
 		 580 aa  302  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  31.84 
 
 		 586 aa  301  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  33.27 
 
 		 593 aa  301  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  33.21 
 
 		 588 aa  301  3e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  32.94 
 
 		 571 aa  301  3e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.83 
 
 		 586 aa  300  4e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4402  ABC transporter related  33.46 
 
 		 584 aa  300  5e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.962719  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  32.59 
 
 		 571 aa  300  7e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.59 
 
 		 571 aa  300  7e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4018  cyclic nucleotide-binding protein  35.43 
 
 		 574 aa  299  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3976  cyclic nucleotide-binding protein  35.43 
 
 		 574 aa  299  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  34.11 
 
 		 593 aa  298  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  34.34 
 
 		 611 aa  298  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  31.81 
 
 		 586 aa  298  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  34.82 
 
 		 572 aa  297  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  31.93 
 
 		 556 aa  297  4e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  35.37 
 
 		 641 aa  297  4e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  31.56 
 
 		 591 aa  296  7e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  32 
 
 		 582 aa  296  7e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  34.02 
 
 		 575 aa  296  7e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.83 
 
 		 586 aa  296  9e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  36.38 
 
 		 610 aa  295  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.38 
 
 		 609 aa  296  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  35.69 
 
 		 642 aa  295  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  34.39 
 
 		 596 aa  295  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.01 
 
 		 586 aa  294  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  31.01 
 
 		 586 aa  294  3e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  35.7 
 
 		 584 aa  294  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.13 
 
 		 586 aa  294  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  30.83 
 
 		 586 aa  294  4e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1150  ATPase  34.21 
 
 		 600 aa  294  4e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.144978  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.13 
 
 		 586 aa  293  5e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  32.71 
 
 		 601 aa  293  7e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  35.11 
 
 		 589 aa  293  8e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  30.83 
 
 		 586 aa  292  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  31 
 
 		 596 aa  292  1e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.83 
 
 		 586 aa  292  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  32.72 
 
 		 601 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  29.5 
 
 		 566 aa  292  1e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.5 
 
 		 566 aa  292  1e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  32.96 
 
 		 606 aa  291  2e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  31.17 
 
 		 596 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.49 
 
 		 596 aa  290  4e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  34.22 
 
 		 636 aa  290  4e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  36.54 
 
 		 567 aa  290  7e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2670  ABC transporter related  33.52 
 
 		 622 aa  290  7e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0292907  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  32.37 
 
 		 601 aa  290  7e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  35.35 
 
 		 602 aa  289  9e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  34.53 
 
 		 607 aa  289  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  33.4 
 
 		 579 aa  289  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  31.19 
 
 		 589 aa  289  1e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  33.27 
 
 		 583 aa  289  1e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  32.61 
 
 		 575 aa  288  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  32.37 
 
 		 598 aa  288  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  36.35 
 
 		 567 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.72 
 
 		 583 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  32.41 
 
 		 651 aa  287  2.9999999999999996e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  35.77 
 
 		 603 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  31.16 
 
 		 586 aa  287  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>