More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1926 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1926  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
582 aa  1179    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0434  cardiolipin synthase  33.73 
 
 
664 aa  305  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0380  phospholipase D/transphosphatidylase  33.89 
 
 
652 aa  305  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3384  cardiolipin synthetase, putative  38.36 
 
 
525 aa  252  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  37.05 
 
 
502 aa  249  9e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0603365 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0101  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.39 
 
 
683 aa  229  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0642638  normal  0.0241528 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1886  cardiolipin synthase  34.78 
 
 
510 aa  225  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.115754  hitchhiker  0.00782832 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03577  cardiolipin synthase  36.34 
 
 
663 aa  225  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2113  phospholipase D protein, putative  29.86 
 
 
522 aa  201  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5588  putative phospholipase D/transphosphatidylase  31.82 
 
 
534 aa  187  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5459  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3039  phopholipase D domain-containing protein  31.1 
 
 
510 aa  186  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2081  putative phospholipase D  30.37 
 
 
510 aa  183  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1146  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.5 
 
 
520 aa  182  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000126804  hitchhiker  4.1949e-17 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1456  phospholipase D/transphosphatidylase  31.66 
 
 
522 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2951  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.11 
 
 
529 aa  176  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0851513 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2154  phospholipase D/transphosphatidylase  28.31 
 
 
518 aa  175  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0310472  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1462  phospholipase D/transphosphatidylase  30.53 
 
 
514 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2100  phospholipase D/transphosphatidylase  30.56 
 
 
506 aa  172  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2333  phospholipase D/transphosphatidylase  28.64 
 
 
514 aa  171  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.271927 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2103  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.89 
 
 
517 aa  171  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4980  phospholipase D/transphosphatidylase  29.32 
 
 
538 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3210  putative phospholipase D protein  31.5 
 
 
529 aa  167  6.9999999999999995e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.824664 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3742  putative phospholipase D protein  29.33 
 
 
548 aa  165  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.135454 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0032  phospholipase D/transphosphatidylase  28.85 
 
 
516 aa  164  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00522964  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1371  phospholipase D/transphosphatidylase  29.49 
 
 
540 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0130503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1424  phospholipase D/transphosphatidylase  29.61 
 
 
544 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.105 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1436  phospholipase D/transphosphatidylase  29.49 
 
 
540 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0951062 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2154  putative phospholipase D precursor  29.7 
 
 
517 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230523  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2900  phospholipase D/transphosphatidylase  27.61 
 
 
507 aa  163  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0104537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0467  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.48 
 
 
534 aa  161  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4284  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.15 
 
 
564 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.730338 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4172  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.15 
 
 
564 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900175  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0663  phospholipase D/transphosphatidylase  28.24 
 
 
535 aa  158  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000324106  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0845  phospholipase D/transphosphatidylase  26.95 
 
 
517 aa  158  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1167  phopholipase D  29.74 
 
 
476 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.383725  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2285  phopholipase D  29.74 
 
 
476 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01043  predicted hydrolase  29.5 
 
 
473 aa  156  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.951902  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2599  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.5 
 
 
493 aa  156  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0536182  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1166  phopholipase D  29.5 
 
 
476 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.130412  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01050  hypothetical protein  29.5 
 
 
473 aa  156  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.795141  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2085  phopholipase D  29.5 
 
 
473 aa  156  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.374109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2014  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.57 
 
 
551 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.384488  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1426  phopholipase D  29.26 
 
 
473 aa  155  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.33637  normal  0.352917 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6079  phospholipase D/transphosphatidylase  30.32 
 
 
541 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2346  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.44 
 
 
524 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2553  phospholipase D/transphosphatidylase  29.5 
 
 
476 aa  155  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.424547  normal  0.39142 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1562  phospholipase D/transphosphatidylase  28.51 
 
 
495 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0457673  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3640  phospholipase D/transphosphatidylase  30.61 
 
 
516 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252485  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3993  phospholipase D/transphosphatidylase  30.05 
 
 
517 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.927932  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4479  phospholipase D/transphosphatidylase  30.61 
 
 
516 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3887  phospholipase D/transphosphatidylase  30.61 
 
 
560 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40611  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0791  phospholipase D  27.25 
 
 
570 aa  153  7e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1732  phospholipase D/transphosphatidylase  28.34 
 
 
543 aa  153  7e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.229068  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70110  putative cardiolipin synthase  27.58 
 
 
529 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0871  phospholipase D/transphosphatidylase  28.23 
 
 
520 aa  153  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336385  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2202  phopholipase D-family protein  25.21 
 
 
508 aa  152  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3283  phospholipase D/transphosphatidylase  28.67 
 
 
505 aa  151  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5532  phospholipase D/transphosphatidylase  27.97 
 
 
522 aa  151  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000670  cardiolipin synthetase  27.23 
 
 
505 aa  151  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3791  phospholipase D/transphosphatidylase  29.5 
 
 
516 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102545  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2668  phospholipase D/transphosphatidylase  28.68 
 
 
540 aa  151  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2558  phospholipase D family protein  30.49 
 
 
550 aa  151  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140702  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0208  putative phospholipase D  30.62 
 
 
550 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1580  putative phospholipase D  30.62 
 
 
550 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1383  putative phospholipase D  30.62 
 
 
550 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0239  putative phospholipase D  30.62 
 
 
550 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0978  phospholipase D, putative  30.49 
 
 
595 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899552  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2801  phospholipase D/transphosphatidylase  28.88 
 
 
540 aa  150  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1811  phospholipase D/transphosphatidylase  27.83 
 
 
532 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52997  normal  0.0386663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2946  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.13 
 
 
557 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.378913  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4772  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.67 
 
 
583 aa  149  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0340  phospholipase D/transphosphatidylase  29.67 
 
 
519 aa  148  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.22272  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0797  phospholipase D/transphosphatidylase  27.71 
 
 
566 aa  148  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2777  phospholipase D/transphosphatidylase  29.47 
 
 
540 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.326922  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2702  phospholipase D family protein  30.47 
 
 
550 aa  147  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2139  phospholipase D/transphosphatidylase  29.6 
 
 
540 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2752  phospholipase D/transphosphatidylase  29.6 
 
 
540 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0142  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.92 
 
 
527 aa  146  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.150882  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5759  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.87 
 
 
519 aa  146  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0547  phospholipase D/transphosphatidylase  30.39 
 
 
549 aa  146  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.954131  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2203  phospholipase D/transphosphatidylase  30.07 
 
 
516 aa  146  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1259  phopholipase D  29.97 
 
 
434 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.515013  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1244  phopholipase D  29.97 
 
 
434 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1215  phopholipase D  29.97 
 
 
434 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.192537 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2041  phopholipase D  29.97 
 
 
434 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00421548  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2225  phopholipase D  29.97 
 
 
434 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6085  putative lipoprotein  28.31 
 
 
517 aa  145  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2055  phospholipase D/transphosphatidylase  29.58 
 
 
515 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0614113  normal  0.204663 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5034  phospholipase D/transphosphatidylase  26.42 
 
 
543 aa  145  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258367  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1771  phospholipase D/transphosphatidylase  26.84 
 
 
515 aa  144  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0473  phospholipase-D family protein  29.69 
 
 
516 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0194  phospholipase D/transphosphatidylase  28.6 
 
 
518 aa  143  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.316787  hitchhiker  0.000208167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5328  phospholipase D/transphosphatidylase  29.35 
 
 
517 aa  143  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0620748 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0796  phospholipase D/transphosphatidylase  28.96 
 
 
562 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829142  normal  0.0553202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5186  phospholipase D/transphosphatidylase  28.89 
 
 
517 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0217001 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1121  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.58 
 
 
535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  29.45 
 
 
516 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0493  phospholipase D, putative  28.57 
 
 
553 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2395  phospholipase D/transphosphatidylase  29.62 
 
 
516 aa  140  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138129  normal  0.528036 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5276  phospholipase D/transphosphatidylase  28.74 
 
 
517 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>