68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1816 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1816  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
265 aa  540  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1358  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  31.98 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0896223 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2914  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  35.47 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2131  hypothetical protein  35.26 
 
 
208 aa  77  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.605971  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16670  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold  29.72 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.242022 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  26.9 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.787985 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6076  putative metal-dependent hydrolase  32.07 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1697  hypothetical protein  29.76 
 
 
211 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2570  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  32.62 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.950272  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  30.19 
 
 
223 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2596  beta-lactamase domain protein  29.76 
 
 
236 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.477747  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2220  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 
225 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  26.67 
 
 
223 aa  62.8  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0154  hypothetical protein  30.11 
 
 
214 aa  61.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.61111  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  26.04 
 
 
218 aa  60.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1586  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.6 
 
 
277 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.600595  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4313  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.54 
 
 
261 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.678939  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1628  hypothetical protein  30 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0944  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.93 
 
 
277 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0306  beta-lactamase domain protein  27.07 
 
 
227 aa  57  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09183  putative metal-dependent hydrolase  30.07 
 
 
270 aa  57  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607675  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3920  putative metal-dependent hydrolase  30.13 
 
 
244 aa  56.2  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2467  hypothetical protein  31.91 
 
 
292 aa  55.8  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1524  beta-lactamase domain-containing protein  29.61 
 
 
285 aa  55.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1271  hypothetical protein  27.74 
 
 
220 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384497  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1544  hypothetical protein  32.32 
 
 
266 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.133061 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1653  metal-dependent hydrolase  28.06 
 
 
226 aa  54.3  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.348192  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0529  hypothetical protein  25.64 
 
 
235 aa  53.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0291  beta-lactamase domain protein  25.28 
 
 
227 aa  53.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0300  metal-dependent hydrolase  27.33 
 
 
225 aa  53.5  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0081  beta-lactamase domain-containing protein  28.06 
 
 
239 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.316272  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2786  beta-lactamase domain-containing protein  25.85 
 
 
225 aa  52.4  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.480164  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1587  metal-dependent hydrolase  27 
 
 
226 aa  52  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.725937  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2288  hypothetical protein  23.44 
 
 
237 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1646  hypothetical protein  25.52 
 
 
221 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1310  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  27.95 
 
 
195 aa  50.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0262357  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4386  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.74 
 
 
278 aa  49.3  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0244983  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1443  beta-lactamase domain protein  24.47 
 
 
224 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.995838  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2098  beta-lactamase domain-containing protein  26.53 
 
 
219 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244954  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2696  metal-dependent hydrolase  27.62 
 
 
226 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0151  metallo-beta-lactamase family protein  27.78 
 
 
240 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2256  Zn-dependent hydrolase  25.71 
 
 
348 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2337  beta-lactamase domain protein  25.97 
 
 
222 aa  47  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  24.83 
 
 
388 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0635  metal-dependent hydrolase  28.41 
 
 
226 aa  45.8  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000707665  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0171  beta-lactamase domain protein  32.53 
 
 
266 aa  45.8  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.389307  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38030  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  27.22 
 
 
211 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1421  beta-lactamase domain-containing protein  27.71 
 
 
224 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.831543  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5227  beta-lactamase domain protein  30.22 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0767  metal-dependent hydrolase  26.21 
 
 
226 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1344  metal-dependent hydrolase  22.58 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0136  metal-dependent hydrolase  28.36 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4722  metal-dependent hydrolase  25.56 
 
 
227 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  22.79 
 
 
376 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6275  hypothetical protein  26.71 
 
 
281 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03775  putative hydrolase  26.75 
 
 
350 aa  43.5  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0379  hypothetical protein  29.59 
 
 
211 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.760291  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4213  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 
225 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0816  beta-lactamase domain-containing protein  27.1 
 
 
222 aa  43.5  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3716  metal-dependent hydrolase  22.15 
 
 
230 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4324  beta-lactamase-like  28.44 
 
 
273 aa  43.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4170  hypothetical protein  24 
 
 
253 aa  43.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0567  hypothetical protein  30.47 
 
 
284 aa  43.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0190057  hitchhiker  0.00000419669 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0515  metal-dependent hydrolase  25.56 
 
 
227 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4860  metal-dependent hydrolase  25.68 
 
 
227 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4729  metal-dependent hydrolase  25.68 
 
 
227 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4507  metal-dependent hydrolase  25.68 
 
 
227 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4343  metal-dependent hydrolase  25.68 
 
 
227 aa  42  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>