240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1444 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1444  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  625  1e-178  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0268  hypothetical protein  45.17 
 
 
311 aa  239  5e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  43.56 
 
 
573 aa  235  7e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2818  hypothetical protein  45.76 
 
 
322 aa  229  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2884  hypothetical protein  42.81 
 
 
333 aa  229  4e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0969686  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0351  hypothetical protein  48.58 
 
 
328 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2179  hypothetical protein  44.95 
 
 
310 aa  223  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000299596  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5003  hypothetical protein  43.06 
 
 
333 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262077  normal  0.0158793 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0952  hypothetical protein  45.7 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.337499  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2004  hypothetical protein  45.02 
 
 
330 aa  220  3e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.594252 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0341  membrane protein  42.3 
 
 
313 aa  219  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1598  hypothetical protein  44.44 
 
 
310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1682  hypothetical protein  43.58 
 
 
315 aa  216  5e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6940  Uncharacterized protein family UPF0324  44.53 
 
 
334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4339  hypothetical protein  44.81 
 
 
319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.37076  normal  0.118932 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4081  hypothetical protein  41.88 
 
 
326 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01436  hypothetical protein  43.61 
 
 
284 aa  212  7.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0104  hypothetical protein  43.99 
 
 
310 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004026  membrane protein  42.96 
 
 
305 aa  203  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0378  hypothetical protein  48.54 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0369  hypothetical protein  48.69 
 
 
328 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0141  hypothetical protein  44.29 
 
 
314 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4708  hypothetical protein  39.62 
 
 
316 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4241  hypothetical protein  38.98 
 
 
316 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4436  hypothetical protein  39.67 
 
 
316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3668  hypothetical protein  47.11 
 
 
318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4296  hypothetical protein  39.67 
 
 
316 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0104  hypothetical protein  39.67 
 
 
316 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3868  hypothetical protein  39.67 
 
 
316 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0216  hypothetical protein  41.61 
 
 
315 aa  188  9e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0187  hypothetical protein  41.92 
 
 
310 aa  185  9e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000719377  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3946  hypothetical protein  42.4 
 
 
316 aa  185  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3853  hypothetical protein  41.6 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4061  hypothetical protein  41.6 
 
 
316 aa  183  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  38.35 
 
 
328 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  33.9 
 
 
360 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  33.9 
 
 
360 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  41.52 
 
 
372 aa  146  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  34.87 
 
 
337 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  34.98 
 
 
335 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  34.58 
 
 
355 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  38.8 
 
 
380 aa  140  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  37.17 
 
 
335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  32.75 
 
 
335 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0344  hypothetical protein  35.83 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  34.47 
 
 
324 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  32.57 
 
 
354 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  33.56 
 
 
339 aa  129  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  31.62 
 
 
355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  30.43 
 
 
340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  30.07 
 
 
340 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  30.07 
 
 
352 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  30.43 
 
 
352 aa  119  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  30.07 
 
 
352 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  30.07 
 
 
340 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  30.07 
 
 
340 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  30.07 
 
 
340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  33.71 
 
 
352 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  31.34 
 
 
348 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  30.43 
 
 
352 aa  112  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  29.92 
 
 
343 aa  113  6e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000804675  normal  0.16942 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  30.43 
 
 
340 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  26.67 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  29.13 
 
 
337 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  26.54 
 
 
377 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  33.33 
 
 
341 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  28.57 
 
 
327 aa  102  7e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0605  hypothetical protein  33.94 
 
 
351 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1714  hypothetical protein  29.92 
 
 
363 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  29.71 
 
 
341 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  27.54 
 
 
357 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  26.67 
 
 
361 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2674  hypothetical protein  29.71 
 
 
362 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1533  hypothetical protein  29.71 
 
 
362 aa  99  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212301  normal  0.210583 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1678  Uncharacterized protein family UPF0324  30.2 
 
 
340 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2755  hypothetical protein  29.71 
 
 
362 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.218534  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  26.01 
 
 
348 aa  98.2  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  30.73 
 
 
343 aa  97.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0419  hypothetical protein  27.98 
 
 
346 aa  96.3  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000120524  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1147  hypothetical protein  29.54 
 
 
345 aa  95.9  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000396509  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3719  hypothetical protein  30.71 
 
 
356 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  25.23 
 
 
349 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  27.99 
 
 
361 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  27.99 
 
 
361 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  31.15 
 
 
356 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  26.13 
 
 
348 aa  94.7  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  26.35 
 
 
349 aa  94  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  26.35 
 
 
349 aa  94  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  26.35 
 
 
349 aa  94  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  26.35 
 
 
349 aa  94  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  26.35 
 
 
349 aa  94  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  26.35 
 
 
349 aa  94  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  26.35 
 
 
349 aa  94  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  26.35 
 
 
349 aa  94  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  28.3 
 
 
368 aa  93.6  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  28.57 
 
 
359 aa  93.2  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  30.6 
 
 
390 aa  92.8  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  30.77 
 
 
356 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1845  hypothetical protein  25.61 
 
 
360 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0726233  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  27.61 
 
 
346 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>