More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1266 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1266  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 357 aa  720    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0892  transcriptional regulator, LacI family  31.28 
 
 		 348 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3000  transcriptional regulator, LacI family  24.57 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114429  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2999  transcriptional regulator, LacI family  24.5 
 
 		 336 aa  97.4  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2505  LacI family transcription regulator  25 
 
 		 342 aa  97.8  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2278  LacI family transcription regulator  28.33 
 
 		 348 aa  96.7  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368367  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  28.08 
 
 		 335 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  27.37 
 
 		 349 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2556  transcriptional regulator, LacI family  25 
 
 		 317 aa  94.4  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000904675  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.29 
 
 		 336 aa  92.4  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  23.64 
 
 		 332 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  23.64 
 
 		 332 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3367  transcriptional regulator, LacI family  25.42 
 
 		 337 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0346  transcriptional regulator, LacI family  29.37 
 
 		 367 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  26.11 
 
 		 334 aa  90.5  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02195  transcription regulator transcription regulator protein  28.12 
 
 		 355 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.479594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1461  transcriptional regulator, LacI family  24.29 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1419  transcriptional regulator, LacI family  28.93 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.933801  normal  0.184887 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1460  transcriptional regulator, LacI family  29.05 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0141269 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1438  transcriptional regulator, LacI family  22.99 
 
 		 337 aa  88.6  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 358 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1481  transcriptional regulator, LacI family  26.55 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4918  transcriptional regulator, LacI family  27.67 
 
 		 346 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1785  LacI family transcription regulator  26.95 
 
 		 334 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  25.07 
 
 		 339 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3841  transcriptional regulator, LacI family  27.67 
 
 		 346 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.455211 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7423  LacI family transcription regulator  30.59 
 
 		 357 aa  87  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.857608 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6359  transcriptional regulator, LacI family  26.61 
 
 		 356 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0432  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.95 
 
 		 334 aa  87  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00486  transcriptional regulator LacI family  25.98 
 
 		 331 aa  86.7  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1459  LacI family transcription regulator  29.72 
 
 		 340 aa  86.7  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1457  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.6 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  25.07 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  25.07 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3336  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.24 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0752084  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2475  transcriptional regulator, LacI family  30.18 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000232076  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5554  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.17 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0347599 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1214  transcriptional regulator, LacI family  26.84 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000107104  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  28.96 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0233  regulatory protein LacI  24.77 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  25 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4566  transcriptional regulator, LacI family  26.02 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4253  LacI family transcription regulator  27.68 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1063  LacI family transcription regulator  25.51 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3125  LacI family transcription regulator  29.04 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.369308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1404  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.83 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00377783  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.57 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0783  transcriptional regulator repressor  25.34 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  29.65 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1790  transcription regulator protein  29.21 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.678671  normal  0.041815 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.51 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0291  alanine racemase  27 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.910588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4716  LacI family transcription regulator  27.88 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417684  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  28.7 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4802  LacI family transcription regulator  27.88 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0881  transcriptional regulator, LacI family  24.42 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00312464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0911  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  25.91 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.107654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  25.7 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  24.3 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4039  DNA-binding transcriptional regulator CytR  27.91 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  25.07 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05070  putative LacI-family transcriptional regulator  21.91 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.697537  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5317  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.06 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188854 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0272  LacI family transcription regulator  28.45 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.419733  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0509  transcriptional regulator, LacI family  25.28 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000057395  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5101  LacI family transcription regulator  27.95 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.181934 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3585  LacI family transcription regulator  24.91 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000546261  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3700  LacI family transcription regulator  22.58 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000696494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4066  LacI family transcription regulator  25 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3669  transcriptional regulator, LacI family  25.9 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.555961  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  27.3 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3513  LacI family transcription regulator  28.22 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.98216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0234  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  23.14 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.762891  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  26.2 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3520  transcriptional regulator, LacI family  25.68 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  28.41 
 
 		 343 aa  79.3  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  28.57 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  27.25 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1860  transcriptional regulator, LacI family  30.45 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5365  transcriptional regulator, LacI family  26.54 
 
 		 345 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000864241  normal  0.850622 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  25.07 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3813  alanine racemase  27.52 
 
 		 340 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0426  transcriptional regulator, LacI family  27.54 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5093  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  22.29 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2662  LacI family transcription regulator  27.67 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767927 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0467  putative raffinose repressor  27.3 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  27.12 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4322  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  25.61 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3799  transcriptional regulator, LacI family  26.74 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  24.86 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4341  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  24.7 
 
 		 325 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  28.19 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5764  transcriptional regulator LacI family  25.35 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.73775  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  28.19 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0713  putative raffinose repressor  27.22 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3579  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.29 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0948  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.92 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.849116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1009  putative raffinose repressor  27.22 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1982  putative raffinose repressor  27.22 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>