More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7423 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7423  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 357 aa  712    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.857608 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0129  transcriptional regulator, LacI family  39.94 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  35.48 
 
 		 347 aa  206  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4515  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.98 
 
 		 351 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5109  LacI family transcription regulator  38.11 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1005  transcriptional regulator, LacI family  31.91 
 
 		 336 aa  176  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  34.94 
 
 		 340 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  35.26 
 
 		 337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  34.04 
 
 		 340 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  34.55 
 
 		 343 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  34.04 
 
 		 340 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  35.67 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  35.67 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  34.45 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  35.67 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  35.67 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  34.45 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  34.04 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  32.43 
 
 		 346 aa  170  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  34.04 
 
 		 332 aa  169  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  32.63 
 
 		 353 aa  169  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  34.15 
 
 		 343 aa  169  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  34.65 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.33 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  31.72 
 
 		 337 aa  166  4e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  33.54 
 
 		 343 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  33.54 
 
 		 343 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  33.54 
 
 		 343 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  33.54 
 
 		 343 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  31.53 
 
 		 346 aa  165  9e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  32.25 
 
 		 339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5702  transcriptional regulator, LacI family  26.65 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.111509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  33.82 
 
 		 342 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3324  LacI family transcription regulator  34.31 
 
 		 347 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370251  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.44 
 
 		 336 aa  164  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 346 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  32.65 
 
 		 343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 		 348 aa  163  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.91 
 
 		 336 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  30.25 
 
 		 386 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  34.24 
 
 		 337 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  34.43 
 
 		 391 aa  161  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  30 
 
 		 335 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  33.84 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  32.04 
 
 		 347 aa  160  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  31 
 
 		 336 aa  159  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  29.73 
 
 		 333 aa  159  7e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  32.93 
 
 		 346 aa  159  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  31.55 
 
 		 334 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  33.33 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  35.26 
 
 		 361 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  32.42 
 
 		 353 aa  158  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  30.33 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2497  Alanine racemase  33.33 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13850  transcriptional regulator, LacI family  34.59 
 
 		 356 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  30.61 
 
 		 329 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5761  transcriptional regulator, LacI family  34.02 
 
 		 363 aa  156  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.230872  normal  0.079116 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.75 
 
 		 341 aa  156  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  30.75 
 
 		 341 aa  156  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.75 
 
 		 341 aa  156  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.75 
 
 		 341 aa  156  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.75 
 
 		 341 aa  156  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.75 
 
 		 343 aa  156  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.75 
 
 		 343 aa  156  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  30.75 
 
 		 341 aa  156  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1559  alanine racemase  29.82 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000066632  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.41 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  31.55 
 
 		 339 aa  153  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  29.9 
 
 		 334 aa  153  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  33.64 
 
 		 337 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  29.64 
 
 		 342 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1601  alanine racemase  31.02 
 
 		 337 aa  152  5.9999999999999996e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.520299  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.7 
 
 		 341 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  30.38 
 
 		 340 aa  152  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1528  transcriptional regulator, LacI family  33.72 
 
 		 356 aa  152  7e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.7 
 
 		 341 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.7 
 
 		 341 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.7 
 
 		 341 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.7 
 
 		 341 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  30.89 
 
 		 332 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2175  transcriptional regulator, LacI family  33.87 
 
 		 349 aa  152  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.408939  normal  0.717598 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1243  LacI family transcription regulator  31.86 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  32.36 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1929  LacI family transcription regulator  31.76 
 
 		 347 aa  152  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959619  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2046  LacI family transcription regulator  31.09 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0282  LacI family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 342 aa  151  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.727359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1481  transcriptional regulator, LacI family  29.94 
 
 		 342 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  31.8 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 		 349 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  33.03 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1631  LacI family transcription regulator  32.39 
 
 		 381 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.213128  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2904  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.56 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.65 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2557  LacI family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 341 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000811694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1873  LacI family response repressor  34.39 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.845568  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4293  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.48 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.719683 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.58 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  31.09 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  32.42 
 
 		 348 aa  150  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0116  transcriptional regulator, LacI family  33.96 
 
 		 346 aa  150  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>