59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0733 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0733  DoxX family protein  100 
 
 		 153 aa  303  6e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.943309  normal  0.707851 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  49.64 
 
 		 164 aa  144  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  49.65 
 
 		 198 aa  125  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  33.59 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  35.2 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  29.85 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  34.4 
 
 		 133 aa  57  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  48.57 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  48.57 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  48.57 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  33.08 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  31.45 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  33.59 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  49.25 
 
 		 216 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  41.79 
 
 		 197 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  36.84 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  42.86 
 
 		 197 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4520  DoxX family protein  33.33 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  41.79 
 
 		 198 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  41.79 
 
 		 197 aa  48.9  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  27.34 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  44.68 
 
 		 131 aa  48.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  32.31 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  32.31 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1739  DoxX family protein  38.81 
 
 		 196 aa  47.4  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2898  DoxX  32.65 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  30.47 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2710  hypothetical protein  47.14 
 
 		 197 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  31.71 
 
 		 181 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  32.84 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  34.82 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  34.91 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  33.73 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  29.32 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  32.63 
 
 		 204 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  34.29 
 
 		 149 aa  43.9  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  33.04 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  30.37 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2995  DoxX family protein  29.59 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00203576  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  32.46 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  31.21 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  31.3 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  38.81 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  35.82 
 
 		 137 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0372  DoxX family protein  29.82 
 
 		 133 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  33.65 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  26.98 
 
 		 137 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  35.82 
 
 		 137 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  35.82 
 
 		 137 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  34.56 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2479  DoxX family protein  44.29 
 
 		 197 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1846  DoxX family protein  44.29 
 
 		 197 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1807  DoxX family protein  44.29 
 
 		 197 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1436  DoxX family protein  30.15 
 
 		 164 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4028  DoxX family protein  40.62 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  26.39 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2690  DoxX  32.5 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.360255  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  33.93 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  30 
 
 		 130 aa  40.4  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>