More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0683 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0683  methyltransferase  100 
 
 
192 aa  377  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00312  putative methyltransferase  38.02 
 
 
228 aa  105  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  39.2 
 
 
187 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1549  methyltransferase  39.15 
 
 
192 aa  97.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0871501  normal  0.284169 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  39.59 
 
 
189 aa  96.7  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  41.36 
 
 
192 aa  95.9  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  43.11 
 
 
187 aa  94.4  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  45.6 
 
 
192 aa  94.7  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  36.94 
 
 
184 aa  94  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1372  hypothetical protein  38.32 
 
 
177 aa  93.2  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.196321  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  38.97 
 
 
185 aa  93.2  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  38.97 
 
 
185 aa  93.2  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1543  methyltransferase  34.17 
 
 
212 aa  92.8  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  41.92 
 
 
187 aa  92  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  42.06 
 
 
189 aa  92  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2560  putative methyltransferase  46.27 
 
 
184 aa  92  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776175  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  41.92 
 
 
187 aa  92  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  45.04 
 
 
185 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  41.27 
 
 
178 aa  92  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0999  methyltransferase  36.14 
 
 
189 aa  91.3  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000716702  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0379  hypothetical protein  41.27 
 
 
190 aa  91.3  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.0081825 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  48.12 
 
 
180 aa  90.9  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  39.41 
 
 
189 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  42.04 
 
 
188 aa  90.5  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  36.42 
 
 
184 aa  89.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  37.04 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  33.53 
 
 
181 aa  89.4  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0901  N-6 adenine-specific DNA methylase  46.27 
 
 
184 aa  89.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  43.08 
 
 
186 aa  89.7  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  39.78 
 
 
183 aa  89.4  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  41.09 
 
 
200 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0736  hypothetical protein  39.68 
 
 
185 aa  89  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.577739 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  36.27 
 
 
208 aa  89  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0774  hypothetical protein  30.34 
 
 
186 aa  88.6  5e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1433  putative methyltransferase  36.21 
 
 
195 aa  88.6  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  31.77 
 
 
199 aa  88.2  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0475  methyltransferase  46.88 
 
 
191 aa  88.2  6e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.576019  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  40.16 
 
 
200 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  37.64 
 
 
185 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1321  methyltransferase  35.67 
 
 
185 aa  87.8  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0301345  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  40.16 
 
 
200 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  40.16 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  32.94 
 
 
181 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  36.88 
 
 
187 aa  87.8  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  41.32 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1630  methyltransferase  34.2 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.798264  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1336  methyltransferase  34.76 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  37.57 
 
 
187 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  45.38 
 
 
185 aa  86.7  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  43.85 
 
 
186 aa  86.7  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  35.59 
 
 
186 aa  86.3  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1881  methyltransferase, putative  32.8 
 
 
183 aa  85.9  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.752838  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  40.11 
 
 
185 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  40.35 
 
 
197 aa  85.5  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  37.13 
 
 
191 aa  85.5  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4197  putative methyltransferase  38.75 
 
 
174 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  40.37 
 
 
174 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1878  methyltransferase  45.11 
 
 
189 aa  85.9  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.0169858 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0056  methyltransferase  32.97 
 
 
215 aa  85.1  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  36.36 
 
 
188 aa  85.5  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  37.06 
 
 
184 aa  85.1  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0309  methyltransferase  42.52 
 
 
204 aa  85.1  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  35.75 
 
 
208 aa  85.1  6e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  38.28 
 
 
189 aa  84.7  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2868  putative methyltransferase  35.45 
 
 
227 aa  84.3  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  33.69 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  45.86 
 
 
185 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18420  putative methyltransferase  36.63 
 
 
184 aa  84  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  46.67 
 
 
185 aa  84.3  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  36.47 
 
 
187 aa  84  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3869  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.6 
 
 
199 aa  84  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.673493  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  32.8 
 
 
198 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3700  methyltransferase  40.41 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0293121  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2441  methyltransferase  24.06 
 
 
183 aa  84  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.585429  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  42.31 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  32.8 
 
 
198 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03538  putative methyltransferase  34.1 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1925  putative methyltransferase  34.2 
 
 
196 aa  84  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  32.8 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf714  N6-adenine-specific methylase  33.33 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  32.8 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  37.14 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  42.97 
 
 
173 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1932  hypothetical protein  32.57 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.007587  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  38.14 
 
 
184 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  32.37 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  37.57 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  32.8 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  32.8 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3945  putative methyltransferase  36.23 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3842  methyltransferase  36.23 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3689  methyltransferase  36.23 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0444848  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  38.58 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  39.55 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  43.08 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4140  methyltransferase  36.23 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  38.69 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  38.24 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  35.8 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  35.94 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>