More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4750 on replicon NC_009670
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011981  Avi_7035  plasmid partitioning protein  62.36 
 
 
571 aa  660    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4477  plasmid partitioning protein  63.83 
 
 
560 aa  698    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0558103  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4659  plasmid partitioning protein  66.1 
 
 
557 aa  735    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4750  plasmid partitioning protein  100 
 
 
597 aa  1210    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9165  plasmid partitioning protein  73 
 
 
612 aa  877    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4317  plasmid partitioning protein  64.56 
 
 
579 aa  766    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9553  plasmid partitioning protein  68.43 
 
 
596 aa  821    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4976  plasmid partitioning protein  67.71 
 
 
559 aa  742    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3729  plasmid partitioning protein  46.08 
 
 
565 aa  457  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183946  normal  0.190659 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  41.82 
 
 
297 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  40.91 
 
 
295 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  40.91 
 
 
295 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  40.91 
 
 
295 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  40.91 
 
 
295 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  40.91 
 
 
295 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  40.91 
 
 
295 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  40.91 
 
 
295 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  41.58 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  35.21 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  43.88 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  35.21 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  35.21 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  35.21 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  40 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  40 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  40 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  34.87 
 
 
274 aa  69.7  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  41.84 
 
 
311 aa  70.1  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  29.01 
 
 
305 aa  70.1  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  43.56 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0050  parB-like partition protein  42.31 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  39 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  42.71 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  32.55 
 
 
706 aa  67.4  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  32.55 
 
 
706 aa  67.4  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  33.33 
 
 
714 aa  67  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  42.57 
 
 
311 aa  67  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  40.59 
 
 
311 aa  67  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  38.68 
 
 
286 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2476  parB-like partition proteins  42.53 
 
 
303 aa  66.6  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.751865  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  34.68 
 
 
297 aa  66.2  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  32.64 
 
 
714 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  36.67 
 
 
299 aa  65.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  34.59 
 
 
694 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  43.68 
 
 
303 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  43.68 
 
 
303 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  35.16 
 
 
295 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  42.35 
 
 
295 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  35.71 
 
 
272 aa  65.1  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  36.28 
 
 
306 aa  64.7  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  40.82 
 
 
303 aa  64.3  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  35.11 
 
 
310 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  37.37 
 
 
282 aa  64.3  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  38.1 
 
 
734 aa  64.3  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  28.97 
 
 
272 aa  63.9  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  31.82 
 
 
292 aa  64.3  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  35.38 
 
 
303 aa  63.9  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  39.66 
 
 
284 aa  63.9  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  32.46 
 
 
712 aa  63.9  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  43.53 
 
 
283 aa  63.5  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2805  chromosome segregation DNA-binding protein  39.58 
 
 
284 aa  63.5  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.012977  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  29.03 
 
 
626 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  29.03 
 
 
626 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  32.32 
 
 
708 aa  63.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  29.03 
 
 
624 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  29.03 
 
 
626 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  29.91 
 
 
288 aa  63.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  30.81 
 
 
624 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  32.21 
 
 
294 aa  62.4  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  31.58 
 
 
298 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  41.41 
 
 
304 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  32.21 
 
 
294 aa  62.4  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  30.81 
 
 
624 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  29.89 
 
 
645 aa  62  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  34.86 
 
 
314 aa  61.6  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  32.47 
 
 
662 aa  62  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  40.44 
 
 
317 aa  61.6  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  35.34 
 
 
286 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  34.09 
 
 
315 aa  61.6  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  33.93 
 
 
295 aa  61.6  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  36.45 
 
 
283 aa  61.2  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5559  parB-like partition protein  39.78 
 
 
400 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  32.21 
 
 
714 aa  61.2  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  40 
 
 
294 aa  60.8  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  35.51 
 
 
291 aa  60.5  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  39.5 
 
 
290 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1403  parB-like partition protein  31.33 
 
 
288 aa  60.5  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  35.83 
 
 
269 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  28.49 
 
 
624 aa  60.1  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  31.51 
 
 
321 aa  59.7  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  37.9 
 
 
298 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  31.5 
 
 
305 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  41.46 
 
 
286 aa  60.1  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  37.9 
 
 
298 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  38.46 
 
 
306 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2569  transcriptional regulator  31.41 
 
 
284 aa  60.1  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3354  chromosome segregation DNA-binding protein  41.57 
 
 
300 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  37.29 
 
 
290 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  33.62 
 
 
283 aa  59.7  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  35.58 
 
 
294 aa  59.3  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>