53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2321 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2321  putative phage repressor  100 
 
 
243 aa  499  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3352  putative phage repressor  39.53 
 
 
240 aa  146  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140887  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2405  putative phage repressor  36.79 
 
 
220 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  35.8 
 
 
244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  29.41 
 
 
235 aa  92  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  27.73 
 
 
241 aa  87  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3831  putative phage repressor  30.84 
 
 
246 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1673  putative phage repressor  29.15 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219867  normal  0.134588 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0258  putative phage repressor  25.12 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5792  putative phage repressor  28.81 
 
 
230 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396613  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1918  putative phage repressor  25.45 
 
 
238 aa  58.9  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.514362  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0858  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 
243 aa  50.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.949499  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  29.29 
 
 
227 aa  49.7  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  30.61 
 
 
208 aa  48.9  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  30.61 
 
 
208 aa  48.9  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  30.61 
 
 
208 aa  48.9  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
252 aa  48.9  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  26.71 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  23.22 
 
 
234 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2209  putative phage repressor  28.71 
 
 
250 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.111819 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  25.13 
 
 
230 aa  47  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
513 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  40.62 
 
 
209 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  30.53 
 
 
140 aa  45.8  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1559  transcriptional regulator, XRE family  28.49 
 
 
262 aa  45.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  30.39 
 
 
182 aa  45.8  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  30.39 
 
 
182 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  30.39 
 
 
182 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  30.39 
 
 
182 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  30.39 
 
 
182 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  23.08 
 
 
113 aa  45.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0168  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0105  DNA-binding protein  27.83 
 
 
199 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  25.76 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
197 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  27.55 
 
 
182 aa  43.9  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  37.31 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2958  transcriptional regulator HTH family  38.18 
 
 
134 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 
219 aa  43.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  27.12 
 
 
201 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  28.29 
 
 
207 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  34.92 
 
 
508 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 
201 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  27.12 
 
 
201 aa  43.5  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  35.48 
 
 
215 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3344  XRE family transcriptional regulator  29.91 
 
 
125 aa  43.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  35.62 
 
 
229 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  35.62 
 
 
229 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 
513 aa  42.4  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3290  transcriptional regulator, XRE family  29.03 
 
 
67 aa  42.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.605967 
 
 
-
 
NC_002978  WD0623  transcriptional regulator, putative  27.08 
 
 
302 aa  42  0.009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0864444  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1142  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 
141 aa  42  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.343255  normal  0.597064 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1555  transcriptional regulator  30.95 
 
 
181 aa  42  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>