More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2313 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 244 aa  484  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0563  cytochrome c oxidase subunit II  51.28 
 
 		 394 aa  229  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3849  cytochrome c oxidase, subunit II  54.55 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  51.63 
 
 		 232 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3098  QoxB, quinol oxidase subunit II  47.91 
 
 		 261 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3668  cytochrome-c oxidase  49.52 
 
 		 378 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.253259  normal  0.882679 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  43.22 
 
 		 336 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  40.27 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3825  cytochrome c oxidase, subunit II  49.44 
 
 		 189 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.495822 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  36.11 
 
 		 346 aa  146  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  39.46 
 
 		 338 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  38.25 
 
 		 327 aa  136  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  37.04 
 
 		 352 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  42.86 
 
 		 315 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  36.65 
 
 		 342 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  36.94 
 
 		 330 aa  132  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  35.84 
 
 		 334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  37.44 
 
 		 346 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  35.38 
 
 		 326 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  38.78 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  37.78 
 
 		 330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1754  cytochrome c, monohaem  37.33 
 
 		 324 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0118  cytochrome c oxidase, subunit IIC  37.33 
 
 		 324 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134505  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  37.76 
 
 		 354 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  37.24 
 
 		 434 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  33.63 
 
 		 367 aa  122  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  37.76 
 
 		 352 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  35.81 
 
 		 334 aa  121  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  38.42 
 
 		 372 aa  121  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  38.12 
 
 		 381 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  37.93 
 
 		 372 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  33.48 
 
 		 370 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  34.89 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  38.69 
 
 		 314 aa  116  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  43.7 
 
 		 370 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  37.24 
 
 		 353 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  35.58 
 
 		 354 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  36.04 
 
 		 425 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  34.6 
 
 		 338 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  33.82 
 
 		 353 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  34.16 
 
 		 371 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  35.96 
 
 		 355 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  42.28 
 
 		 389 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  46.79 
 
 		 322 aa  108  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  35.14 
 
 		 324 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3968  ubiquinol oxidase, subunit II  35.47 
 
 		 300 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  44.54 
 
 		 350 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  31.1 
 
 		 311 aa  102  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  44.54 
 
 		 350 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  44.54 
 
 		 350 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0407  cytochrome c oxidase, subunit II  35.51 
 
 		 435 aa  101  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  45.05 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  32.06 
 
 		 345 aa  99.8  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  44.95 
 
 		 318 aa  99.4  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  35 
 
 		 316 aa  98.6  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  41.51 
 
 		 426 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  35 
 
 		 311 aa  98.2  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  41.18 
 
 		 302 aa  97.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  40.94 
 
 		 351 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5009  ubiquinol oxidase, subunit II  34.23 
 
 		 299 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348819  normal  0.0229485 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  41.12 
 
 		 316 aa  95.5  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  41.12 
 
 		 301 aa  95.5  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  40.19 
 
 		 300 aa  94.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1637  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  43.86 
 
 		 297 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140878  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  29.55 
 
 		 377 aa  94  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  43.62 
 
 		 330 aa  93.2  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  41.12 
 
 		 351 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3523  quinol oxidase AA3, subunit II  32.62 
 
 		 301 aa  92.8  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  29.89 
 
 		 304 aa  92.4  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  39.13 
 
 		 359 aa  92  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2071  ubiquinol oxidase, subunit II  42.98 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.741779  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0730  cytochrome c oxidase, subunit II  27.36 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.255439  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  43.88 
 
 		 336 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  35.66 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  32.84 
 
 		 211 aa  91.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3649  ubiquinol oxidase, subunit II  31.58 
 
 		 299 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2090  ubiquinol oxidase, subunit II  42.61 
 
 		 281 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6006  ubiquinol oxidase, subunit II  42.98 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1209  ubiquinol oxidase, subunit II  33.05 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0864701  normal  0.353676 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4128  cytochrome c oxidase subunit II  33.1 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4600  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  29.71 
 
 		 291 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00365456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  39.81 
 
 		 315 aa  90.9  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  43.81 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  33.55 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0658  cytochrome C oxidase subunit II transmembrane region  31.11 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.508316  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  41.67 
 
 		 275 aa  90.1  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  27.1 
 
 		 314 aa  90.1  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  35.71 
 
 		 329 aa  89.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  41.67 
 
 		 321 aa  89.7  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  38.46 
 
 		 342 aa  89.4  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  37.39 
 
 		 313 aa  89  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0830  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  30.53 
 
 		 291 aa  89  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0772  quinol oxidase, subunit II  30.53 
 
 		 291 aa  89  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0669  quinol oxidase subunit II  30.53 
 
 		 291 aa  89  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0613  quinol oxidase, subunit 2 (cytochrome c oxidase, subunit II)  30.53 
 
 		 291 aa  89  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0614  quinol oxidase, subunit 2 (cytochrome c oxidase, subunit II)  30.53 
 
 		 291 aa  89  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0737  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  30.53 
 
 		 291 aa  89  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0350513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0703  quinol oxidase subunit II  30.53 
 
 		 291 aa  89  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  39.81 
 
 		 320 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  43.75 
 
 		 147 aa  89  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>