129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1821 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  100 
 
 
195 aa  391  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153367  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1746  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  86.01 
 
 
194 aa  308  4e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  48.96 
 
 
195 aa  177  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  49.19 
 
 
194 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  49.19 
 
 
194 aa  176  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  49.47 
 
 
196 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1271  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  46.67 
 
 
195 aa  167  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189432  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4737  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  45.41 
 
 
196 aa  162  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0088  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.25 
 
 
202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.14 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1436  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  29.34 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.878923  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0763  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.46 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  41.41 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.59 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.05 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.05 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.7 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.15 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.15 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.15 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.93 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.93 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5364  hypothetical protein  33.88 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865399  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  28.34 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1797  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.29 
 
 
203 aa  62.4  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3527  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.62 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.528255  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13450  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  36.19 
 
 
219 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4789  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.42 
 
 
219 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.11 
 
 
202 aa  59.3  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2216  hypothetical protein  30 
 
 
189 aa  58.9  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.660461  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.38 
 
 
219 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1871  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30 
 
 
189 aa  58.9  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0919541  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01050  protein-S-isoprenylcysteine O-methyltransferase, putative  34.15 
 
 
257 aa  58.5  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442432  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3939  hypothetical protein  33.01 
 
 
200 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227544  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0012  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.25 
 
 
219 aa  57.8  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0810  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.33 
 
 
150 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6308  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.38 
 
 
214 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06162  Prenylcystein carboxymethyl transferase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7SI75]  33.03 
 
 
322 aa  56.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.423115  normal  0.603581 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60928  predicted protein  31.68 
 
 
243 aa  56.2  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2179  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
219 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0028  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.67 
 
 
219 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.7 
 
 
191 aa  55.1  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.32 
 
 
219 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12464  hypothetical protein  30.53 
 
 
139 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.364998  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0208  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5417  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.29 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5444  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.29 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2834  hypothetical protein  28.21 
 
 
210 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.12794 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4825  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.29 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1224  hypothetical protein  31.82 
 
 
186 aa  52.4  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.74 
 
 
207 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3970  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  36.17 
 
 
209 aa  51.6  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.64 
 
 
224 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.843705 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9832  predicted protein  31.33 
 
 
187 aa  51.2  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5391  hypothetical protein  24.49 
 
 
203 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2219  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.04 
 
 
225 aa  50.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0421811 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1112  hypothetical protein  30.11 
 
 
147 aa  50.1  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25890  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  28.87 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0446  hypothetical protein  25 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.752234  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1466  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.51 
 
 
222 aa  48.9  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3689  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.21 
 
 
170 aa  48.9  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.699231  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1571  hypothetical protein  25.41 
 
 
202 aa  48.5  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.249934  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_86391  predicted protein  27.5 
 
 
196 aa  48.5  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  26.89 
 
 
166 aa  48.1  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20970  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  28.9 
 
 
184 aa  48.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03462  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase (icmt) family  30.34 
 
 
90 aa  48.1  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0193  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.74 
 
 
229 aa  48.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00375189  decreased coverage  0.000266905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3245  hypothetical protein  26.96 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2616  Transmembrane protein  29.35 
 
 
158 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0186317  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2564  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.6 
 
 
230 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.48 
 
 
209 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2810  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  35.29 
 
 
198 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0252  hypothetical protein  31.96 
 
 
151 aa  47  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.329609  normal  0.630144 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1589  hypothetical protein  27.45 
 
 
182 aa  46.6  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0775913  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1182  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.14 
 
 
210 aa  46.2  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0205  hypothetical protein  30.19 
 
 
164 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.17 
 
 
159 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900207 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0211  hypothetical protein  30.19 
 
 
164 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02064  hypothetical protein  26.55 
 
 
153 aa  46.2  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10821  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  24.79 
 
 
188 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.198126  normal  0.195099 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1432  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.68 
 
 
187 aa  46.2  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2408  hypothetical protein  32.47 
 
 
164 aa  45.4  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1937  hypothetical protein  29.9 
 
 
215 aa  45.4  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.481786  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5689  hypothetical protein  26.17 
 
 
198 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.414471 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5738  hypothetical protein  26.96 
 
 
224 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.937074  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3685  hypothetical protein  26.17 
 
 
207 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5322  hypothetical protein  26.17 
 
 
198 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.633891 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0267  hypothetical protein  26.47 
 
 
180 aa  44.7  0.0009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0782  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.63 
 
 
157 aa  44.7  0.0009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2341  hypothetical protein  25.81 
 
 
221 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0419  hypothetical protein  27.64 
 
 
214 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2732  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.1 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4105  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.82 
 
 
206 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.698715  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.58 
 
 
222 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3315  hypothetical protein  23.48 
 
 
159 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0211298 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2688  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.95 
 
 
227 aa  44.3  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0484  hypothetical protein  29.91 
 
 
161 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3566  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31.87 
 
 
196 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.273519  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0824  hypothetical protein  28.57 
 
 
166 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.259993  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>