49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2408 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2408  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  323  5e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0205  hypothetical protein  82.32 
 
 		 164 aa  275  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0211  hypothetical protein  82.32 
 
 		 164 aa  275  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1868  hypothetical protein  47.24 
 
 		 173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0267  hypothetical protein  47.24 
 
 		 180 aa  144  5e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2611  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  43.87 
 
 		 176 aa  110  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2391  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.31 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2103  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.76 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11162  hypothetical protein  23.53 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.247941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5141  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.63 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.60085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1087  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.85 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00510  hypothetical protein  24.81 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.798456 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2329  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  23.49 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2376  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  23.49 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2368  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  23.49 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1904  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.15 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.654377  hitchhiker  0.000324365 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1612  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  23.33 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1950  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.49 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0227  hypothetical protein  26.61 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2732  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.79 
 
 		 202 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1869  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.61 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1195  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  23.85 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1076  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  24.83 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1060  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  24.83 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0763  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.87 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1159  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  24.82 
 
 		 172 aa  52.4  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.772846  hitchhiker  0.00322732 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4104  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.88 
 
 		 169 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.346459  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13450  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.26 
 
 		 212 aa  50.4  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0203  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase domain-containing protein  27.27 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5116  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.97 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1085  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  23.72 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.47 
 
 		 195 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153367  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1887  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.32 
 
 		 201 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0866287  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5653  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.59 
 
 		 167 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0028  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.87 
 
 		 219 aa  44.7  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0088  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.23 
 
 		 202 aa  44.3  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.59 
 
 		 219 aa  44.3  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1746  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.67 
 
 		 194 aa  44.3  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.21 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1871  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.26 
 
 		 189 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0919541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2216  hypothetical protein  28.26 
 
 		 189 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.660461  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0429  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.86 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  27.35 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  27.35 
 
 		 194 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0397  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  45.71 
 
 		 167 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.16097 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  24.49 
 
 		 219 aa  41.6  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1767  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.17 
 
 		 284 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0820574  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.69 
 
 		 218 aa  40.8  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.69 
 
 		 218 aa  40.8  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>