More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1665 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1665  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  100 
 
 		 393 aa  790    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.502772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2329  aminotransferase, class V  78.77 
 
 		 399 aa  551  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2842  aminotransferase, class V  66.15 
 
 		 390 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2741  aminotransferase class V  64.25 
 
 		 390 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2995  aminotransferase, class V  64.68 
 
 		 388 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0581835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3965  cysteine desulfurase  63.05 
 
 		 387 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.707417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2455  aminotransferase, class V  62.56 
 
 		 390 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2434  cysteine desulfurase  52.89 
 
 		 387 aa  353  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2108  aminotransferase class V  50.8 
 
 		 405 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44473  normal  0.0661399 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1901  aminotransferase class V  50.8 
 
 		 388 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_004310  BR0930  cysteine desulfurase, putative  49.87 
 
 		 392 aa  323  5e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0484195  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0924  putative cysteine desulfurase  49.87 
 
 		 392 aa  322  7e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2257  aminotransferase class V  48.68 
 
 		 386 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4470  aminotransferase class V  51.06 
 
 		 424 aa  308  8e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.425504 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3263  aminotransferase class V  49.73 
 
 		 400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.867544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1469  aminotransferase class V  49.47 
 
 		 402 aa  305  9.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.747649  normal  0.0112306 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4456  aminotransferase class V  48.28 
 
 		 390 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259181  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0809  aminotransferase, class V  45.21 
 
 		 382 aa  299  7e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0512399  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5849  aminotransferase class V  46.35 
 
 		 391 aa  293  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4344  aminotransferase class V  45.65 
 
 		 390 aa  292  7e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5110  aminotransferase class V  48.44 
 
 		 391 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400085 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  45.36 
 
 		 379 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1609  aminotransferase class V  51.09 
 
 		 392 aa  288  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129216 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1782  aminotransferase, class V  47.21 
 
 		 388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2027  aminotransferase, class V  49.33 
 
 		 368 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159236  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0097  aminotransferase class V  47.2 
 
 		 393 aa  281  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.765035 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0693  aminotransferase class V  47.91 
 
 		 389 aa  279  5e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456582  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  46.34 
 
 		 1143 aa  276  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  45.5 
 
 		 1139 aa  273  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  46.99 
 
 		 383 aa  272  7e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  39.73 
 
 		 384 aa  271  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2587  aminotransferase class V  49.31 
 
 		 377 aa  271  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.577396  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  40.41 
 
 		 397 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3976  aminotransferase class V  45.65 
 
 		 390 aa  269  7e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  39.73 
 
 		 384 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  43.32 
 
 		 386 aa  268  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  40.67 
 
 		 381 aa  268  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  39.51 
 
 		 392 aa  267  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  40 
 
 		 401 aa  267  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  40.96 
 
 		 400 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  44.2 
 
 		 387 aa  265  7e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1949  aminotransferase, class V  45.83 
 
 		 385 aa  265  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000781244  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  39.8 
 
 		 398 aa  265  1e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  42.78 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  42.08 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  40.31 
 
 		 398 aa  263  3e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  40.1 
 
 		 401 aa  261  1e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  41.78 
 
 		 394 aa  260  3e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0628  rrf2/aminotransferase, class V family protein  36.5 
 
 		 492 aa  259  4e-68  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54422  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  39.13 
 
 		 402 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  39.27 
 
 		 381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  39.48 
 
 		 381 aa  259  6e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  43.09 
 
 		 385 aa  259  7e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  39.67 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  39.57 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0304  rrf2/aminotransferase, class V family protein  40.53 
 
 		 530 aa  258  1e-67  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  38.96 
 
 		 381 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  39.24 
 
 		 401 aa  258  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  39.22 
 
 		 381 aa  257  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  39.74 
 
 		 398 aa  257  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  44.41 
 
 		 1135 aa  257  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  39.22 
 
 		 381 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  39.59 
 
 		 398 aa  256  6e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  42.08 
 
 		 396 aa  256  6e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  38.74 
 
 		 381 aa  256  7e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  38.7 
 
 		 381 aa  255  8e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  38.7 
 
 		 381 aa  255  8e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  38.7 
 
 		 381 aa  255  8e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0705  aminotransferase, class V  38.98 
 
 		 378 aa  255  1.0000000000000001e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  39.06 
 
 		 381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  42.78 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  38.73 
 
 		 383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  38.74 
 
 		 381 aa  254  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  43.04 
 
 		 382 aa  253  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  38.99 
 
 		 392 aa  253  4.0000000000000004e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  40.42 
 
 		 400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2884  cysteine desulfurase  46.43 
 
 		 373 aa  253  6e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0675  aminotransferase, class V  44.03 
 
 		 385 aa  253  6e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00811405  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40 
 
 		 389 aa  252  8.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0411  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 533 aa  251  1e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.206912  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  40.48 
 
 		 388 aa  251  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  39.3 
 
 		 398 aa  252  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  38.59 
 
 		 394 aa  250  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5030  aminotransferase class V  41.47 
 
 		 388 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  43.37 
 
 		 387 aa  249  7e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  41.79 
 
 		 409 aa  247  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  39.73 
 
 		 403 aa  248  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1312  aminotransferase, class V  42.82 
 
 		 387 aa  248  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.085766  normal  0.715303 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  39.01 
 
 		 393 aa  247  3e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  41.51 
 
 		 404 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  40.98 
 
 		 399 aa  246  4e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  38.68 
 
 		 380 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2295  aminotransferase class V  41.6 
 
 		 394 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0121543 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  40.8 
 
 		 382 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  44.12 
 
 		 388 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06940  cysteine desulfurase family protein  42.49 
 
 		 395 aa  245  9.999999999999999e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.417246  normal  0.55711 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  41.1 
 
 		 383 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  45.63 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  42.42 
 
 		 408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  40.67 
 
 		 382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>