36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0267 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  100 
 
 		 872 aa  1779    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  37.6 
 
 		 868 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  37.24 
 
 		 874 aa  538  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0127  hypothetical protein  30.87 
 
 		 869 aa  380  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2026  hypothetical protein  28.52 
 
 		 897 aa  278  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.657836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4992  hypothetical protein  29.8 
 
 		 881 aa  273  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4456  hypothetical protein  28.16 
 
 		 833 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.681645 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7587  SMC domain-containing protein  28.48 
 
 		 873 aa  263  8e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328529  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4940  hypothetical protein  28.88 
 
 		 878 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188257  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3692  hypothetical protein  26.61 
 
 		 891 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000374969 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0643  ATPase  26.41 
 
 		 781 aa  242  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  27.13 
 
 		 895 aa  226  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6595  hypothetical protein  27.35 
 
 		 880 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3054  hypothetical protein  27.55 
 
 		 896 aa  202  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0107  hypothetical protein  25.89 
 
 		 869 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2596  hypothetical protein  25.2 
 
 		 887 aa  160  9e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.889024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2640  hypothetical protein  25.2 
 
 		 887 aa  160  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06300  hypothetical protein  25.2 
 
 		 854 aa  160  9e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7689  hypothetical protein  39.66 
 
 		 597 aa  158  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  23.24 
 
 		 844 aa  65.9  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2668  hypothetical protein  34 
 
 		 695 aa  53.5  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1363  SMC protein-like  23.52 
 
 		 875 aa  52.8  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.922778  normal  0.196985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3982  hypothetical protein  28.69 
 
 		 881 aa  51.6  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0815711  hitchhiker  0.00348599 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3987  hypothetical protein  28 
 
 		 803 aa  50.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  38.36 
 
 		 796 aa  49.3  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1272  hypothetical protein  27.08 
 
 		 874 aa  47.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  35.42 
 
 		 717 aa  47.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2338  hypothetical protein  27.08 
 
 		 874 aa  47.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000220057  unclonable  0.000000361106 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5100  SMC domain protein  35.14 
 
 		 676 aa  47.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.797675 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0450  SMC domain protein  25.25 
 
 		 877 aa  47  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.292453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3707  SMC domain-containing protein  29.21 
 
 		 881 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0892  hypothetical protein  36.49 
 
 		 890 aa  45.8  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1420  hypothetical protein  29.73 
 
 		 874 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5366  hypothetical protein  32.06 
 
 		 892 aa  44.7  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.0115994 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  33.61 
 
 		 770 aa  44.7  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1580  SMC domain protein  30.1 
 
 		 818 aa  44.3  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.338996  normal  0.282314 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>