43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2501 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2501  O-antigen polymerase  100 
 
 		 784 aa  1595    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2251  O-antigen polymerase  46.89 
 
 		 561 aa  500  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.220671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0127  hypothetical protein  26.86 
 
 		 845 aa  227  7e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0051  O-antigen polymerase  28.11 
 
 		 735 aa  211  6e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000539528  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1664  O-antigen polymerase  25.84 
 
 		 806 aa  198  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1253  O-antigen polymerase  25.96 
 
 		 832 aa  181  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0517425 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3138  O-antigen polymerase  25.22 
 
 		 761 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4145  O-antigen polymerase  23.99 
 
 		 799 aa  145  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.373234  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2346  O-antigen polymerase  24.48 
 
 		 1009 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0470801  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2016  O-antigen polymerase  25.87 
 
 		 769 aa  98.6  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1732  tetratricopeptide TPR_4  30.77 
 
 		 805 aa  87.4  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000559511  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  25.86 
 
 		 433 aa  55.1  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  28.77 
 
 		 754 aa  52.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3515  O-antigen polymerase domain-containing protein  26.87 
 
 		 410 aa  51.2  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3646  O-antigen polymerase  26.87 
 
 		 410 aa  51.2  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0851  O-antigen polymerase domain-containing protein  26.87 
 
 		 410 aa  51.2  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.852584 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 3145 aa  51.2  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  29.03 
 
 		 773 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  28.17 
 
 		 745 aa  49.3  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2933  O-antigen polymerase  26.85 
 
 		 458 aa  48.9  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205816  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  28.92 
 
 		 889 aa  48.5  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 2262 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  21.43 
 
 		 737 aa  48.1  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 465 aa  47.8  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 597 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 		 827 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1451  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 585 aa  47.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24 
 
 		 2240 aa  47  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.1 
 
 		 863 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  23.29 
 
 		 467 aa  45.8  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  29.47 
 
 		 389 aa  45.8  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  26.09 
 
 		 1764 aa  45.4  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0243  TPR repeat-containing protein  21.49 
 
 		 208 aa  45.4  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.127552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 		 1737 aa  45.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4577  O-antigen polymerase  27.56 
 
 		 480 aa  45.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0257  O-antigen polymerase  26.32 
 
 		 419 aa  44.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2888  type IV pilus biogenesis protein PilF, putative  27.14 
 
 		 255 aa  44.7  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0271  O-antigen polymerase  20.34 
 
 		 760 aa  44.3  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 713 aa  44.3  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2035  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 194 aa  44.7  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0362  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 1075 aa  44.3  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.574464  normal  0.999715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 2262 aa  44.3  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 374 aa  44.3  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>