108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0362 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0120  TPR repeat-containing protein  80.15 
 
 
1095 aa  1634    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0362  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
1075 aa  2121    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.574464  normal  0.999715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3396  TPR repeat-containing protein  41.91 
 
 
1075 aa  726    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3321  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 
1141 aa  577  1.0000000000000001e-163  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  22.46 
 
 
870 aa  66.6  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  25.97 
 
 
795 aa  61.6  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 
878 aa  61.6  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  27.19 
 
 
1764 aa  60.8  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 
827 aa  58.9  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  26.09 
 
 
875 aa  58.5  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 
648 aa  58.5  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 
847 aa  57.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.32 
 
 
725 aa  56.2  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 
744 aa  56.6  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.09 
 
 
3145 aa  55.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.52 
 
 
641 aa  55.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 
686 aa  55.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  38.67 
 
 
1005 aa  54.3  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.14 
 
 
1979 aa  53.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  26.37 
 
 
545 aa  53.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.26 
 
 
810 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 
597 aa  52.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.62 
 
 
292 aa  52.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 
265 aa  52  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.33 
 
 
1034 aa  51.6  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 
4489 aa  51.6  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.35 
 
 
1694 aa  51.6  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.2 
 
 
632 aa  51.2  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  23.18 
 
 
732 aa  51.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.14 
 
 
1676 aa  50.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  25.7 
 
 
708 aa  50.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 
879 aa  50.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4022  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 
628 aa  50.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 
715 aa  50.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 
1276 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 
221 aa  49.7  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 
317 aa  49.7  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  23.93 
 
 
676 aa  50.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 
670 aa  49.7  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
465 aa  49.3  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 
767 aa  49.3  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.89 
 
 
884 aa  49.3  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  27.5 
 
 
714 aa  48.9  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 
3301 aa  48.9  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 
1714 aa  48.9  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 
1406 aa  48.5  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 
4079 aa  48.9  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  22.6 
 
 
542 aa  48.5  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.65 
 
 
465 aa  48.9  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 
559 aa  48.5  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.62 
 
 
818 aa  48.5  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 
927 aa  48.1  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 
792 aa  48.1  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.31 
 
 
988 aa  48.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 
635 aa  48.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 
649 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 
635 aa  48.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0684  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 
626 aa  47.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  25.36 
 
 
648 aa  47.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 
265 aa  47.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 
605 aa  47.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1014  TPR domain-containing protein  25.38 
 
 
670 aa  47.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02750  cytoplasm protein, putative  29.41 
 
 
338 aa  47  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.42 
 
 
397 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 
3035 aa  47  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45893  predicted protein  24.75 
 
 
565 aa  47  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 
602 aa  46.6  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2615  TPR domain-containing protein  29.81 
 
 
196 aa  46.2  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 
595 aa  46.2  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 
634 aa  46.2  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0757  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 
222 aa  46.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572611  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  25.39 
 
 
837 aa  46.2  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  24.88 
 
 
623 aa  46.2  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 
326 aa  46.6  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 
611 aa  46.2  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.19 
 
 
639 aa  46.6  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 
366 aa  45.8  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 
968 aa  46.2  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  21.62 
 
 
733 aa  46.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 
714 aa  45.8  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.8 
 
 
557 aa  45.8  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7193  transcriptional regulator, SARP family  31.68 
 
 
641 aa  45.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0854307  normal  0.06484 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
1069 aa  45.8  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 
615 aa  45.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  23.98 
 
 
1138 aa  45.4  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  29.03 
 
 
198 aa  45.4  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 
3172 aa  45.4  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  24.86 
 
 
205 aa  45.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.5 
 
 
1056 aa  45.4  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  25.63 
 
 
456 aa  45.4  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  21.98 
 
 
766 aa  45.4  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 
601 aa  45.1  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  22.33 
 
 
1154 aa  45.1  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
750 aa  45.1  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 
620 aa  45.1  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 
747 aa  45.1  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 
718 aa  45.1  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  20.53 
 
 
1737 aa  45.1  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  24.72 
 
 
587 aa  44.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  21.25 
 
 
622 aa  45.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>