More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2119 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0955  ABC transporter related  50 
 
 		 837 aa  803    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1467  ABC transporter related  62.58 
 
 		 843 aa  1012    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0686  ABC transporter related  57.87 
 
 		 843 aa  954    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.409076 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1665  excinuclease ATPase subunit  47.24 
 
 		 846 aa  767    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19390  Excinuclease ATPase subunit  61.05 
 
 		 837 aa  1008    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000025916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2119  ABC transporter related  100 
 
 		 836 aa  1668    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0836  excinuclease ATPase subunit  60.94 
 
 		 862 aa  972    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  37.24 
 
 		 834 aa  542  1e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  38.89 
 
 		 860 aa  536  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  42.56 
 
 		 776 aa  532  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  37.41 
 
 		 853 aa  534  1e-150  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  40.05 
 
 		 843 aa  531  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  38.09 
 
 		 838 aa  529  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  37.31 
 
 		 822 aa  527  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  38.48 
 
 		 850 aa  525  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  40.05 
 
 		 863 aa  525  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  38.13 
 
 		 861 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  37.62 
 
 		 838 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  39.7 
 
 		 827 aa  521  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  37.03 
 
 		 843 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  38.41 
 
 		 838 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  36.23 
 
 		 877 aa  514  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  36 
 
 		 844 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  39.35 
 
 		 848 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  39.46 
 
 		 848 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3676  excinuclease ABC subunit A  39.66 
 
 		 880 aa  510  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.090284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  39.35 
 
 		 848 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0951  ABC transporter related  40.37 
 
 		 833 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.321909 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  37.69 
 
 		 898 aa  503  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  37.92 
 
 		 832 aa  505  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  37.8 
 
 		 898 aa  502  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  37.91 
 
 		 838 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5800  ABC transporter related  37.9 
 
 		 899 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.177592  normal  0.587186 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  37.57 
 
 		 851 aa  487  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6320  excinuclease ABC, A subunit  37.03 
 
 		 885 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.687364  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1518  ABC transporter related  32.67 
 
 		 823 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.168965 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2265  ABC transporter related  33.73 
 
 		 820 aa  486  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.285501  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1787  ABC transporter related  40.87 
 
 		 845 aa  481  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184754  normal  0.778498 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  36.86 
 
 		 894 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  36.18 
 
 		 950 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2123  excinuclease ABC, A subunit  37.55 
 
 		 944 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429692 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  36.15 
 
 		 944 aa  469  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2710  excinuclease ABC subunit A  36.68 
 
 		 1008 aa  465  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00698098 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0314  excinuclease ABC, A subunit  37.66 
 
 		 988 aa  466  1e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634429  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1160  excinuclease ABC, A subunit  36.03 
 
 		 953 aa  464  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0455  excinuclease ABC subunit A  39.48 
 
 		 916 aa  463  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0811639  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1322  excinuclease ABC, A subunit  36.89 
 
 		 934 aa  462  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0124703  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1170  excinuclease ABC, A subunit  38.07 
 
 		 973 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0157  excinuclease ABC, A subunit  34.01 
 
 		 954 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.352383  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0440  excinuclease ABC subunit A  39.17 
 
 		 916 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.674144  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1750  excinuclease ABC, A subunit  34.42 
 
 		 951 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.173115 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2882  excinuclease ABC, A subunit  37.02 
 
 		 964 aa  460  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  36.38 
 
 		 947 aa  458  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  37.15 
 
 		 957 aa  458  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  36.39 
 
 		 881 aa  456  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0976  excinuclease ABC subunit A  36.83 
 
 		 931 aa  457  1e-127  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.177637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2009  excinuclease ABC, A subunit  37.07 
 
 		 880 aa  457  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1084  excinuclease ABC, A subunit  36.7 
 
 		 936 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0427  excinuclease ABC subunit A  36.13 
 
 		 944 aa  453  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0800  excinuclease ABC subunit A  36.33 
 
 		 948 aa  453  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  36.62 
 
 		 954 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0783  excinuclease ABC subunit A  36.33 
 
 		 948 aa  453  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.686779  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0853  excinuclease ABC subunit A  34.15 
 
 		 954 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  35.74 
 
 		 946 aa  452  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3091  excinuclease ABC, A subunit  38.12 
 
 		 987 aa  449  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_487  excinuclease ATPase subunit  35.79 
 
 		 946 aa  451  1e-125  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0328859  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1893  excinuclease ABC, A subunit  35.4 
 
 		 945 aa  451  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0808708  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  34.62 
 
 		 939 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1317  excinuclease ATPase subunit  36.25 
 
 		 953 aa  450  1e-125  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.133455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  38.18 
 
 		 946 aa  451  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3843  excinuclease ABC subunit A  35.98 
 
 		 957 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0554  excinuclease ABC, A subunit  35.29 
 
 		 938 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  37.66 
 
 		 945 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  35.11 
 
 		 927 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3709  excinuclease ABC subunit A  35.15 
 
 		 956 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1187  excinuclease ABC, A subunit  38.67 
 
 		 965 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07070  Excinuclease ABC subunit A  38.36 
 
 		 954 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.478607 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  38.03 
 
 		 971 aa  448  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1127  excinuclease ABC subunit A  38.53 
 
 		 966 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1601  excinuclease ABC, A subunit  34.27 
 
 		 960 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.409115  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1158  excinuclease ABC subunit A  34.14 
 
 		 941 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  34.76 
 
 		 939 aa  449  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4529  excinuclease ABC subunit A  35.89 
 
 		 1004 aa  447  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388668 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  34.37 
 
 		 942 aa  448  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5328  excinuclease ABC subunit A  35.44 
 
 		 958 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3893  excinuclease ABC subunit A  35.98 
 
 		 957 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0968231 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  36.28 
 
 		 952 aa  447  1.0000000000000001e-124  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3325  excinuclease ABC, A subunit  37.66 
 
 		 937 aa  446  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5271  excinuclease ABC subunit A  35.3 
 
 		 958 aa  445  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  35.16 
 
 		 958 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  35.16 
 
 		 958 aa  444  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10450  Excinuclease ABC subunit A  38.31 
 
 		 960 aa  446  1e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0436929  hitchhiker  0.0000000651145 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  36.89 
 
 		 946 aa  443  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5395  excinuclease ABC subunit A  35.16 
 
 		 958 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1256  excinuclease ABC, A subunit  38.53 
 
 		 966 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145328  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0522  excinuclease ABC subunit A  35.44 
 
 		 944 aa  444  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0045705  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0393  excinuclease ABC subunit A  36.97 
 
 		 952 aa  444  1e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5251  excinuclease ABC subunit A  35.16 
 
 		 958 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1104  excinuclease ABC subunit A  35.06 
 
 		 939 aa  444  1e-123  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  37.29 
 
 		 955 aa  443  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>