248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1136 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1136  peptidase A24A domain-containing protein  100 
 
 
261 aa  481  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  48.41 
 
 
275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  47.01 
 
 
263 aa  181  8.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  50.38 
 
 
261 aa  179  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  41.67 
 
 
274 aa  157  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  42.45 
 
 
283 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  40.67 
 
 
280 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2985  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  37.04 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.749856 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4659  peptidase A24A domain protein  41.31 
 
 
270 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165962 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  34.72 
 
 
300 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  35.34 
 
 
290 aa  148  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.31 
 
 
259 aa  148  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  36.4 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  35.34 
 
 
290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  39.01 
 
 
283 aa  145  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  33.93 
 
 
301 aa  145  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.89 
 
 
293 aa  145  9e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  38.89 
 
 
293 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  38.04 
 
 
289 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  41.3 
 
 
248 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.29 
 
 
288 aa  142  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  37.9 
 
 
259 aa  142  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0310  prepilin peptidase  38.32 
 
 
288 aa  142  7e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  37.82 
 
 
288 aa  142  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0199  Prepilin peptidase  38.34 
 
 
270 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0204  peptidase A24A domain protein  38.34 
 
 
270 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  38.01 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.58 
 
 
308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  35.92 
 
 
289 aa  139  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  38.15 
 
 
289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  37.32 
 
 
288 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  38.54 
 
 
294 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  33.68 
 
 
308 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.15 
 
 
293 aa  139  6e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  37.68 
 
 
288 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  33.7 
 
 
289 aa  138  8.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  33.33 
 
 
308 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.22 
 
 
273 aa  138  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  32.51 
 
 
308 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  38.89 
 
 
261 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3682  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  39.78 
 
 
295 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.96 
 
 
281 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  37.55 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58770  type 4 prepilin peptidase PilD  36.1 
 
 
290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.896389  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  37.08 
 
 
263 aa  136  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  33.33 
 
 
304 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  32.98 
 
 
304 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5164  type 4 prepilin peptidase PilD  35.74 
 
 
290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  34.17 
 
 
289 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  34.54 
 
 
259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  37.08 
 
 
274 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  35.44 
 
 
283 aa  135  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  31.8 
 
 
308 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  33.81 
 
 
303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.02 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  31.27 
 
 
295 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  44.09 
 
 
262 aa  133  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  33.33 
 
 
297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  35.23 
 
 
274 aa  132  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2707  Prepilin peptidase  36.73 
 
 
293 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3921  prepilin peptidase  37.91 
 
 
294 aa  132  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  33.06 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  36.1 
 
 
288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  34.38 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  40 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  40 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3072  Prepilin peptidase  37.82 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.373458  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.2 
 
 
309 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3425  prepilin peptidase  33.75 
 
 
308 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195496  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2962  prepilin peptidase  38.89 
 
 
295 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0970  prepilin peptidase  34.57 
 
 
273 aa  128  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  33.7 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  33.7 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4822  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.17 
 
 
290 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.823452  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  32.66 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  31.68 
 
 
264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.35 
 
 
283 aa  125  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0843  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  37.72 
 
 
285 aa  125  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120524  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  37.65 
 
 
247 aa  125  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  40.56 
 
 
258 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  34.75 
 
 
253 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1581  Prepilin peptidase  33.21 
 
 
294 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3325  prepilin peptidase  32.6 
 
 
290 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  34.3 
 
 
291 aa  123  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2827  type 4 prepilin peptidase bifunctionnal: leader peptidase and N-methyltransferase transmembrane protein  35.61 
 
 
294 aa  122  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00920454  normal  0.142968 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2571  Type IV leader peptidase family protein  34.33 
 
 
247 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  32.03 
 
 
303 aa  122  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3391  prepilin peptidase  29.29 
 
 
305 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2273  signal peptidase type IV  34.33 
 
 
247 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0067  prepilin peptidase  32.4 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000398253  normal  0.330687 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0773  prepilin peptidase  31.5 
 
 
289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  29.07 
 
 
265 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0682  peptidase A24A domain-containing protein  56.67 
 
 
290 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.301277  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.83 
 
 
299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  37.87 
 
 
296 aa  119  7e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  34.25 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  36.43 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0427  peptidase A24A domain protein  40.09 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  37.78 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0637  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.8 
 
 
284 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000248086  normal  0.774777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>