226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2152 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2152  integral membrane protein TerC  100 
 
 		 405 aa  800    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.305703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  44.14 
 
 		 328 aa  271  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  41.74 
 
 		 320 aa  263  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  42.63 
 
 		 331 aa  262  6.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  43.79 
 
 		 328 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  44.12 
 
 		 328 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  42.63 
 
 		 322 aa  256  5e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  41.69 
 
 		 311 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  42.72 
 
 		 311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  44.64 
 
 		 328 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  40.69 
 
 		 329 aa  250  4e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  39.25 
 
 		 322 aa  247  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  42.5 
 
 		 318 aa  246  6e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  40.19 
 
 		 325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  41.69 
 
 		 314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  41.98 
 
 		 313 aa  243  6e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3366  Integral membrane protein TerC  46.83 
 
 		 440 aa  242  7e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404586  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  40.13 
 
 		 306 aa  242  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  39.94 
 
 		 307 aa  240  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  39.69 
 
 		 323 aa  239  5.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  40.06 
 
 		 310 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  42.02 
 
 		 321 aa  238  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  39.12 
 
 		 320 aa  237  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  40.5 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  38.44 
 
 		 325 aa  236  7e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  44.25 
 
 		 327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  42.86 
 
 		 327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  39.25 
 
 		 325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  43.49 
 
 		 327 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  40 
 
 		 325 aa  231  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  35.83 
 
 		 321 aa  230  3e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  35.51 
 
 		 321 aa  229  7e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  40.31 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  39.81 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  41.04 
 
 		 314 aa  227  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  39.41 
 
 		 352 aa  226  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  40.13 
 
 		 317 aa  226  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  40.13 
 
 		 322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  36.31 
 
 		 308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  39.5 
 
 		 321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  39.5 
 
 		 321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  39.38 
 
 		 321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  40.13 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  39.5 
 
 		 320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  39.5 
 
 		 321 aa  226  6e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  39.5 
 
 		 321 aa  226  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  39.35 
 
 		 317 aa  226  6e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  40.13 
 
 		 322 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  39.5 
 
 		 321 aa  226  6e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  39.5 
 
 		 321 aa  226  6e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  40.13 
 
 		 322 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  40.13 
 
 		 322 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  40.38 
 
 		 325 aa  225  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  36.89 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  39.76 
 
 		 324 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  39.45 
 
 		 325 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  42.25 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  38.24 
 
 		 311 aa  223  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2993  integral membrane protein TerC  39.63 
 
 		 339 aa  224  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  39.17 
 
 		 317 aa  223  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  42.42 
 
 		 347 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  39.44 
 
 		 318 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  37.61 
 
 		 354 aa  222  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  40.25 
 
 		 329 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  41.69 
 
 		 354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  39.69 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  37.62 
 
 		 316 aa  219  5e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  38.85 
 
 		 317 aa  219  5e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  40.56 
 
 		 313 aa  219  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  39.94 
 
 		 327 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  39.94 
 
 		 327 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  38.39 
 
 		 320 aa  219  7e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  38.01 
 
 		 312 aa  219  7e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  36.58 
 
 		 360 aa  219  8.999999999999998e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  39.64 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  36.73 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  39.63 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  42.32 
 
 		 354 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  39.7 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  39.35 
 
 		 317 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  39.7 
 
 		 325 aa  218  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  39.64 
 
 		 328 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  41.09 
 
 		 354 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  39.64 
 
 		 328 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  39.64 
 
 		 328 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  36.1 
 
 		 318 aa  216  5e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05912  hypothetical protein  36.53 
 
 		 343 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  40.75 
 
 		 354 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  40.4 
 
 		 314 aa  216  7e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  39.39 
 
 		 325 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  38.41 
 
 		 319 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  38.35 
 
 		 338 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  39.01 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  39.45 
 
 		 330 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1094  protein alx  38.22 
 
 		 314 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.901246  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0027  protein alx  38.22 
 
 		 314 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  40.19 
 
 		 344 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  40.58 
 
 		 308 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  37.46 
 
 		 320 aa  213  5.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  36.51 
 
 		 305 aa  213  5.999999999999999e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>