37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0634 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0634  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 
407 aa  840    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0907  BNR repeat-containing protein  60.81 
 
 
395 aa  497  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4091  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  46.63 
 
 
402 aa  326  6e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4249  putative signal peptide protein  38.13 
 
 
421 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0577112  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4137  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  38.13 
 
 
421 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.56922  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_003296  RS05315  putative signal peptide protein  37.6 
 
 
417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.559524 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0883  hypothetical protein  38.76 
 
 
419 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0724858  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0871  hypothetical protein  38.04 
 
 
419 aa  269  8e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4119  hypothetical protein  38.07 
 
 
422 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000696005  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1599  BNR/Asp-box repeat-containing protein  38.56 
 
 
423 aa  263  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157669  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0147  hypothetical protein  39.25 
 
 
416 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0999  hypothetical protein  39.25 
 
 
416 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2629  hypothetical protein  39.25 
 
 
416 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2998  hypothetical protein  39.25 
 
 
416 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734005  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3036  putative lipoprotein  39.25 
 
 
385 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101874  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2934  hypothetical protein  38.98 
 
 
416 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112131  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2387  hypothetical protein  38.71 
 
 
419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1024  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.82 
 
 
402 aa  252  8.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4533  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.19 
 
 
408 aa  252  9.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883363  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2903  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35 
 
 
402 aa  240  4e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2994  BNR repeat-containing protein  30.24 
 
 
416 aa  216  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.949051  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0677  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.6 
 
 
417 aa  204  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0743281  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0486  BNR repeat-containing protein  28.39 
 
 
415 aa  187  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6943  hypothetical protein  26.42 
 
 
403 aa  109  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2497  hypothetical protein  30.77 
 
 
432 aa  91.3  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0531892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4533  hypothetical protein  24.82 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.739511 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13533  BNR repeat protein  21.85 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2169  BNR repeat-containing protein  25 
 
 
459 aa  67.8  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.361013  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0328  BNR repeat-containing protein  28.24 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6809  hypothetical protein  24.39 
 
 
352 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6858  hypothetical protein  24.63 
 
 
349 aa  63.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.809186  normal  0.870097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1514  hypothetical protein  27.04 
 
 
312 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.148663  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3122  hypothetical protein  22.94 
 
 
437 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.720281  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1368  hypothetical protein  25.86 
 
 
455 aa  53.9  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.553065 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2136  BNR repeat-containing protein  29.87 
 
 
409 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531782  normal  0.415332 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2199  hypothetical protein  29.3 
 
 
190 aa  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4524  hypothetical protein  29.03 
 
 
617 aa  43.9  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.691049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>