More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1698 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1698  ammonium transporter  100 
 
 		 521 aa  1042    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.300416 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  46.71 
 
 		 449 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  47.02 
 
 		 467 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  46.48 
 
 		 451 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  47.23 
 
 		 402 aa  365  1e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  43.76 
 
 		 436 aa  364  2e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  46.6 
 
 		 434 aa  363  6e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  44.47 
 
 		 457 aa  350  3e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  42.7 
 
 		 406 aa  349  6e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  43.83 
 
 		 402 aa  348  1e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  44.01 
 
 		 515 aa  347  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2784  ammonium transporter  45.23 
 
 		 400 aa  346  6e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  43.9 
 
 		 399 aa  346  7e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  44.23 
 
 		 515 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  46.26 
 
 		 397 aa  342  8e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  44.67 
 
 		 397 aa  342  1e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  44.05 
 
 		 434 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  43.33 
 
 		 398 aa  339  7e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  45.35 
 
 		 444 aa  337  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  44.18 
 
 		 462 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  44.25 
 
 		 489 aa  336  5e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  42.58 
 
 		 488 aa  335  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  43.61 
 
 		 429 aa  333  4e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  46.14 
 
 		 408 aa  332  1e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  45.92 
 
 		 408 aa  332  1e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  45.71 
 
 		 461 aa  332  1e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  43.91 
 
 		 485 aa  331  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  43.61 
 
 		 428 aa  331  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  45.92 
 
 		 408 aa  329  7e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  42.57 
 
 		 405 aa  329  8e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2272  ammonium transporter  42.26 
 
 		 467 aa  328  1.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.220314  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  44.03 
 
 		 435 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  46.04 
 
 		 445 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  43.91 
 
 		 507 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  43.74 
 
 		 461 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  42.48 
 
 		 496 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  41.65 
 
 		 405 aa  327  5e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  44.62 
 
 		 464 aa  323  5e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0157  ammonium transporter  42.38 
 
 		 405 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  45.15 
 
 		 411 aa  320  3.9999999999999996e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3626  ammonium transporter  40.62 
 
 		 499 aa  320  5e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  42.83 
 
 		 466 aa  320  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  42.83 
 
 		 500 aa  320  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  42.83 
 
 		 466 aa  320  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  42.83 
 
 		 500 aa  320  6e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  42.83 
 
 		 466 aa  320  6e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  42.83 
 
 		 444 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  42.83 
 
 		 478 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5498  ammonium transporter  41.24 
 
 		 500 aa  318  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  42.38 
 
 		 469 aa  317  5e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  42.07 
 
 		 438 aa  316  7e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  42.07 
 
 		 438 aa  316  7e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  42.26 
 
 		 463 aa  315  9e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  43.71 
 
 		 438 aa  315  9.999999999999999e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  41.94 
 
 		 431 aa  315  9.999999999999999e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1817  ammonium transporter  42.18 
 
 		 500 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.664398  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  42.73 
 
 		 433 aa  315  9.999999999999999e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  41.1 
 
 		 410 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  40.31 
 
 		 410 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  40.88 
 
 		 410 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  40.88 
 
 		 410 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  40.88 
 
 		 410 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  43.81 
 
 		 433 aa  312  7.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0218  ammonium transporter  46.27 
 
 		 445 aa  312  9e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  40.66 
 
 		 410 aa  311  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  41.67 
 
 		 500 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  41.67 
 
 		 500 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  41.67 
 
 		 500 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  40.31 
 
 		 411 aa  311  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  40.66 
 
 		 410 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  43.27 
 
 		 501 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  43.48 
 
 		 442 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  41.67 
 
 		 500 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  42.7 
 
 		 459 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  41.45 
 
 		 499 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0189  ammonium transporter  45.61 
 
 		 445 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  40.66 
 
 		 410 aa  310  4e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2956  ammonium transporter  42.92 
 
 		 470 aa  310  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.328394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  41.43 
 
 		 453 aa  310  4e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5294  ammonium transporter  45.8 
 
 		 443 aa  309  8e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  41.06 
 
 		 504 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0292  ammonium transporter  40.46 
 
 		 500 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  43.83 
 
 		 470 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  45.37 
 
 		 444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  41.89 
 
 		 502 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  41.91 
 
 		 434 aa  308  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  43.45 
 
 		 442 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2099  ammonium transporter  40.9 
 
 		 498 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315626  normal  0.0101926 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  42.05 
 
 		 431 aa  307  3e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2375  ammonium transporter  40.9 
 
 		 498 aa  307  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.442944 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  41.11 
 
 		 445 aa  307  4.0000000000000004e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  42.67 
 
 		 433 aa  307  4.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0157  hypothetical protein  42.35 
 
 		 399 aa  306  6e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.588146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  40.96 
 
 		 466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  41.72 
 
 		 436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  41.5 
 
 		 431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2051  ammonium transporter  40.7 
 
 		 498 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.608567  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5233  ammonium transporter  45.8 
 
 		 443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5142  ammonium transporter  45.8 
 
 		 443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1270  ammonium transporter  42.98 
 
 		 461 aa  305  2.0000000000000002e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>