More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1619 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1619  response regulator receiver protein  100 
 
 		 116 aa  231  3e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0452  response regulator receiver protein  50.47 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000249276 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0707  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 216 aa  90.9  5e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0251  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0465  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000462355 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  37.07 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  32.76 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0637  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94997e-26 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0531  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2054  response regulator receiver domain-containing protein  35.96 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595634 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0623  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1536  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  35.4 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1982  response regulator receiver protein  32.71 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2244  response regulator receiver protein  32.71 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.502053  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3314  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 124 aa  67  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 122 aa  67  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1596  response regulator receiver  29.46 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3198  chemotaxis protein CheY  32.43 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3151  response regulator receiver protein  37.27 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276361  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.93 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0376  response regulator receiver protein  26.79 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10690  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  44.3 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0960  response regulator receiver protein  37.27 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1385  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  31.82 
 
 		 460 aa  64.3  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1909  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 220 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.631594  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1980  response regulator receiver  34.86 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1649  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.831857  normal  0.0382738 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.84 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2037  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 120 aa  62  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0999958  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2798  response regulator receiver  37.65 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.151747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  31.4 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  30.25 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  31.4 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3794  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 376 aa  62.4  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0277983  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4317  response regulator receiver domain-containing protein  31.03 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.619141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4453  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1333  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0479  response regulator receiver protein  27.83 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4472  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3211  response regulator receiver domain-containing protein  30.28 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000097826 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3151  response regulator receiver  33.33 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.332536 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2445  response regulator receiver  29.17 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.942791  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  30.25 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  30.25 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4359  ATPase domain-containing protein  28.7 
 
 		 494 aa  60.8  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191758  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  42.17 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4140  response regulator receiver protein  27.83 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000406755  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3159  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.76 
 
 		 212 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  43.04 
 
 		 242 aa  60.8  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  39.76 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  39.76 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  39.76 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  39.76 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  39.76 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  39.76 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  26.72 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0811  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  39.76 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2855  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.32 
 
 		 217 aa  60.8  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4462  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1436  response regulator  40.96 
 
 		 214 aa  60.5  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  39.76 
 
 		 214 aa  60.5  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  38.55 
 
 		 226 aa  60.1  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0703  LuxR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000151408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1181  response regulator receiver  42.03 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.928438  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0722  response regulator receiver protein  29.73 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1556  response regulator receiver domain-containing protein  31.53 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0651  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.97 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  32.76 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  40.51 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1097  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 		 915 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1081  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.63 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>