More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0251 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0251  response regulator receiver protein  100 
 
 		 126 aa  250  4.0000000000000004e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0376  response regulator receiver protein  41.27 
 
 		 125 aa  110  9e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0452  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 130 aa  100  9e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000249276 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0707  response regulator receiver protein  42.34 
 
 		 216 aa  99.8  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0465  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000462355 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1619  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4140  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000406755  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0960  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3151  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276361  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  31.19 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  32.74 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1083  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 		 887 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.240403  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  42.86 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3314  response regulator receiver protein  40.85 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2877  response regulator receiver protein  39.58 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.412079  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0237  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.390769  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2784  response regulator receiver protein  31.5 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0945133  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1034  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.114962  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  30.91 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1980  response regulator receiver  38.89 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0953  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0255772  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  31.53 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1097  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 		 915 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  30.69 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  35.64 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1622  capsular synthesis two-component sensor kinase and response regulator transcription regulator protein  30.7 
 
 		 1098 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.34 
 
 		 425 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.141244  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2620  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 532 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  36.19 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  30.84 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1202  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3532  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.82 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.998897  normal  0.150916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20780  putative two-component response regulator  33.64 
 
 		 571 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1679  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2891  response regulator receiver protein  32.08 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486665  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  30.84 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1784  putative two-component response regulator  33.64 
 
 		 571 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1206  response regulator receiver protein  40.66 
 
 		 145 aa  62  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  29.47 
 
 		 120 aa  62  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  34.95 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  39 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0822  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.35 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.628591  normal  0.692285 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0479  response regulator receiver protein  29.2 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0248  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.75 
 
 		 358 aa  62  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.185703  normal  0.030578 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3211  response regulator receiver domain-containing protein  35.92 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000097826 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  37.62 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1059  response regulator receiver protein  36.14 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0577913  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1536  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2314  sporulation transcriptional activator Spo0A  31.36 
 
 		 259 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.453721  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1372  response regulator receiver protein  32.98 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000494587  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0064  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316528 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2037  response regulator receiver protein  30.91 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0999958  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3857  response regulator receiver protein  41.98 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0827  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  29.75 
 
 		 460 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1318  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  38.82 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  38.82 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  33.33 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0958  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 734 aa  60.5  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  38.82 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1058  response regulator receiver domain-containing protein  31.3 
 
 		 181 aa  60.5  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000718409  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  34.86 
 
 		 121 aa  60.1  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.67 
 
 		 317 aa  60.5  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0656  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.06 
 
 		 346 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000622897 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1438  response regulator receiver protein  29.89 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0726214  normal  0.0482802 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 396 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  38.82 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  38.82 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  38.82 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 396 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1516  two component transcriptional regulator  37.14 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346089  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  39.19 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  38.82 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  38.82 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1246  histidine kinase  32.79 
 
 		 762 aa  60.1  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0124717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2886  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8267e-27 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  38.82 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5352  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.38 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  38.82 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2798  response regulator receiver  36.14 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.151747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0976  anti-sigma-factor antagonist  34.62 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0986  chemotaxis response regulator  30.09 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2323  two component CheB methylesterase  38.4 
 
 		 370 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>