More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0064 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0064  response regulator receiver protein  100 
 
 		 124 aa  255  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316528 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0532  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.43 
 
 		 470 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00706375  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1528  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.62 
 
 		 479 aa  65.1  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.163365  normal  0.0518301 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  37.84 
 
 		 389 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  37.25 
 
 		 1177 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1417  two component Fis family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 492 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.4 
 
 		 488 aa  62  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01810  transcriptional regulatory protein  31.45 
 
 		 226 aa  62  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  32.23 
 
 		 1127 aa  62  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3865  ATP-binding region, ATPase-like  33.64 
 
 		 1122 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4080  DNA-binding response regulator, LuxR family  29.6 
 
 		 222 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1059  response regulator receiver protein  27.19 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0577913  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0251  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1118  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 452 aa  60.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000972917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0653  sensor histidine kinase  30.51 
 
 		 1124 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.450749  normal  0.469118 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2262  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 406 aa  60.1  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.146487 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  28.33 
 
 		 121 aa  60.1  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1442  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 		 1122 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3100  response regulator  30.51 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.182729  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0488  response regulator receiver protein  34.33 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2427  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2009  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2765  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.82 
 
 		 949 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.266073  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2844  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.82 
 
 		 957 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.436473  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1308  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.82 
 
 		 949 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00392012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  31.62 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2150  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 443 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4431  response regulator receiver domain-containing protein  29.6 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1385  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  33.04 
 
 		 460 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 		 1122 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0612415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1240  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.79 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6548  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 397 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.543575 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0974  two component LuxR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 309 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.426964 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2247  response regulator receiver protein  26.5 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.135382  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1869  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.93 
 
 		 464 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2331  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000425244  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0495  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 456 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  33.93 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0373  two component transcriptional regulator  32.03 
 
 		 246 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3866  response regulator receiver  34.38 
 
 		 309 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.370865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3585  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.03 
 
 		 246 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0667387  hitchhiker  0.00000255607 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 440 aa  57.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0289  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.97 
 
 		 232 aa  57.8  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000126796  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2008  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 404 aa  58.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325522 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2915  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  26.32 
 
 		 457 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 233 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1992  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 460 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  32.5 
 
 		 235 aa  57.8  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3350  sensor histidine kinase/GGDEF domain-containing protein  29.91 
 
 		 565 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 437 aa  57.4  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3585  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 306 aa  57.4  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.295986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0591  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 301 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477799  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2975  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0989438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3017  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.203071 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 2539 aa  57.4  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2335  response regulator receiver protein  28.21 
 
 		 411 aa  57.4  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000388714  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1713  two component LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 361 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.310925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1954  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.93 
 
 		 464 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2783  two component transcriptional regulator  32.81 
 
 		 245 aa  57  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1850  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.549411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2956  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 365 aa  57.4  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3147  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 302 aa  57  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01831  two-component response regulator  37.01 
 
 		 290 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 846 aa  57  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118602  normal  0.0390699 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  30.83 
 
 		 225 aa  57  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0944  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.21 
 
 		 480 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.58 
 
 		 254 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2739  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 451 aa  56.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.693002  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  33.93 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  30 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17451  two-component response regulator  34.75 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4136  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000660181  hitchhiker  0.00876613 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1258  two component Fis family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 486 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0328  response regulator receiver domain-containing protein  29.2 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.918345  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5666  two component LuxR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 		 1023 aa  56.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1886  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.31 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  30.89 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3730  two component LuxR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  31.67 
 
 		 2476 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4638  two component LuxR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1980  response regulator receiver  27.1 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0080  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.41 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5459  sporulation initiation phosphotransferase F  25.42 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000856307  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3268  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  30.91 
 
 		 957 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00176531  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5466  stage 0 sporulation protein F  25.42 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0750811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5036  stage 0 sporulation protein F  25.42 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000486089  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 386 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5581  stage 0 sporulation protein F  25.42 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132264  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2406  response regulator receiver domain-containing protein  29.2 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5514  sporulation initiation phosphotransferase F  25.42 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000170867  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0378  two component transcriptional regulator  29.66 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1773  two component transcriptional regulator  29.91 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4465  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 437 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1934  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 476 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808753  normal  0.132653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>