More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2534 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
328 aa  664    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  77.51 
 
 
329 aa  501  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.24 
 
 
330 aa  429  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.39 
 
 
328 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 
311 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 
309 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.11 
 
 
313 aa  116  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.8 
 
 
353 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 
310 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 
341 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.55 
 
 
346 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  29.6 
 
 
345 aa  102  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.88 
 
 
336 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  29.09 
 
 
341 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  28.73 
 
 
341 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  29.09 
 
 
340 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  27.99 
 
 
324 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  28.73 
 
 
340 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  28.73 
 
 
340 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  26.36 
 
 
306 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
345 aa  97.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  28.73 
 
 
345 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  27.69 
 
 
340 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  30.29 
 
 
306 aa  95.5  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 
327 aa  95.1  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  25.62 
 
 
306 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  25.62 
 
 
306 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  26.36 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  27.59 
 
 
313 aa  93.6  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.07 
 
 
352 aa  92.8  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 
335 aa  92.8  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6794  NAD dependent epimerase/dehydratase family  28.01 
 
 
331 aa  92.4  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  26.3 
 
 
307 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.69 
 
 
337 aa  90.5  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.472972 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  25.57 
 
 
323 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  26.99 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 
336 aa  89.4  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  27.13 
 
 
301 aa  88.2  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  25.91 
 
 
341 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  29.75 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 
331 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.22 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.89 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.99 
 
 
335 aa  79.3  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 
330 aa  79.3  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  28.41 
 
 
331 aa  79.3  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 
330 aa  79  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.71 
 
 
329 aa  78.2  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  28.22 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5628  hypothetical protein  31.94 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  33.91 
 
 
694 aa  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5572  hypothetical protein  33.17 
 
 
295 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  31.94 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5128  hypothetical protein  32.82 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045189 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5143  hypothetical protein  30.37 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.673361  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  30.69 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5301  hypothetical protein  30.89 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  30.37 
 
 
292 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5697  hypothetical protein  30.37 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.91 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5789  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.82 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0435819 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.73 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.47 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.08 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.364855 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2232  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.55 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0415  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.01 
 
 
324 aa  69.3  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.021137  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06090  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.06 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262708  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4331  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.87 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0590  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.31 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1314  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.54 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0478  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.97 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  unclonable  0.00000000000851226  decreased coverage  0.0000000042699 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.02 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.93 
 
 
306 aa  67  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.10516  normal  0.125028 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.29 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  29.34 
 
 
329 aa  66.6  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.86 
 
 
363 aa  66.6  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.29 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.54 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6286  Isoflavone_redu, isoflavone reductase  34.13 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1572  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.78 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3358  NmrA family protein  27.41 
 
 
330 aa  65.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.94 
 
 
316 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
309 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.5 
 
 
334 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1506  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.94 
 
 
364 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185126  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 
310 aa  65.1  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.949606  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3167  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.78 
 
 
343 aa  64.3  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.55 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>