71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1209 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1209  WD40-like protein repeat-like protein  100 
 
 
446 aa  899    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.415141  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  28.7 
 
 
795 aa  91.3  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  30.84 
 
 
963 aa  77.8  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  31.03 
 
 
1311 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  27.43 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  31.2 
 
 
1454 aa  69.7  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  27.85 
 
 
463 aa  68.6  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  27.22 
 
 
431 aa  67.8  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  24.94 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  28.76 
 
 
450 aa  65.9  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1091  Pyrrolo-quinoline quinone  36.03 
 
 
402 aa  63.9  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1740  Pyrrolo-quinoline quinone  24.33 
 
 
451 aa  63.9  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4195  Pyrrolo-quinoline quinone  23.28 
 
 
404 aa  61.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  22.74 
 
 
445 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  28.03 
 
 
438 aa  58.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  24.09 
 
 
514 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  24.5 
 
 
423 aa  57.4  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  26.1 
 
 
1328 aa  57  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  24.35 
 
 
809 aa  56.6  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  25.7 
 
 
1241 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2894  Pyrrolo-quinoline quinone  27.78 
 
 
406 aa  55.8  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0786698  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  29.52 
 
 
352 aa  55.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  28.43 
 
 
455 aa  54.3  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  25.35 
 
 
497 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000580169  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  25 
 
 
1300 aa  54.3  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  26.94 
 
 
402 aa  53.9  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1327  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  26.6 
 
 
423 aa  53.9  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0513  Pyrrolo-quinoline quinone  29.56 
 
 
422 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  23.47 
 
 
407 aa  51.6  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  25.3 
 
 
1969 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  25.88 
 
 
395 aa  51.2  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.88 
 
 
395 aa  51.2  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  25.07 
 
 
484 aa  50.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  25.3 
 
 
2036 aa  50.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  28.37 
 
 
469 aa  50.4  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1270  Pyrrolo-quinoline quinone  24.43 
 
 
426 aa  50.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  29.69 
 
 
432 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  26.33 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0160  Pyrrolo-quinoline quinone  25.9 
 
 
471 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0726185  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4237  Pyrrolo-quinoline quinone  22.41 
 
 
588 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000286239  hitchhiker  0.000138853 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  23.61 
 
 
1067 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1500  Pyrrolo-quinoline quinone  30.15 
 
 
407 aa  48.5  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0717216  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  23.62 
 
 
445 aa  47.8  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2204  Pyrrolo-quinoline quinone  23.06 
 
 
444 aa  47.8  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  31.74 
 
 
372 aa  47.4  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  26.46 
 
 
475 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  24.39 
 
 
374 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  31.62 
 
 
797 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  24.73 
 
 
1812 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  28.32 
 
 
371 aa  45.8  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.13 
 
 
386 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1615  Pyrrolo-quinoline quinone  23.4 
 
 
390 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904136 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0582  Pyrrolo-quinoline quinone  24.69 
 
 
400 aa  44.7  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.812129  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3619  Pyrrolo-quinoline quinone  37.07 
 
 
581 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  24.67 
 
 
412 aa  44.3  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2415  putative quinoprotein alcohol dehydrogenase  28.76 
 
 
577 aa  44.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168343  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  27.94 
 
 
439 aa  43.9  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  27.75 
 
 
1682 aa  44.3  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3015  Pyrrolo-quinoline quinone  25.61 
 
 
416 aa  43.9  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  25.78 
 
 
396 aa  43.9  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  29.41 
 
 
392 aa  43.9  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  29.41 
 
 
392 aa  43.9  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.41 
 
 
392 aa  43.9  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.41 
 
 
392 aa  43.9  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.41 
 
 
392 aa  43.9  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.41 
 
 
392 aa  43.9  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.41 
 
 
392 aa  43.9  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  28.57 
 
 
386 aa  43.5  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.41 
 
 
392 aa  43.1  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  26.91 
 
 
365 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  22.46 
 
 
774 aa  43.1  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>