87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4629 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4629  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  424  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4379  hypothetical protein  89.81 
 
 		 206 aa  366  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.686834  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4355  hypothetical protein  89.18 
 
 		 194 aa  342  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.051926  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2730  Methyltransferase type 12  57.77 
 
 		 207 aa  250  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294095  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6193  hypothetical protein  55.5 
 
 		 204 aa  227  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2344  Methyltransferase type 12  52.97 
 
 		 205 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.499373 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2103  Methyltransferase type 12  53.73 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2423  hypothetical protein  51.96 
 
 		 223 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0485  SAM binding protein  58.64 
 
 		 209 aa  208  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63470  putative methyltransferase  51.52 
 
 		 205 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.42526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0120  Methyltransferase type 12  48.53 
 
 		 209 aa  199  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4066  hypothetical protein  53.57 
 
 		 294 aa  197  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0356205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1362  methyltransferase type 12  47.78 
 
 		 206 aa  196  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4843  methyltransferase type 12  50 
 
 		 205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2989  methyltransferase type 12  42.72 
 
 		 206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.563154  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2231  Methyltransferase type 12  47.72 
 
 		 203 aa  186  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.487897 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2603  hypothetical protein  47.72 
 
 		 203 aa  186  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.329351  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0157  hypothetical protein  47.5 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.376043 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6933  hypothetical protein  45.05 
 
 		 207 aa  181  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0971  methyltransferase type 12  41.06 
 
 		 210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1383  thiopurine S-methyltransferase  30.68 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875719  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  30.22 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  22.92 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  30.27 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  23.41 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  22.92 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  22.92 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  22.92 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  22.4 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  22.92 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  23.41 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  31.03 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  23.96 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  33.59 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2424  methyltransferase type 11  42.35 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.226259 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  23.19 
 
 		 229 aa  51.6  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0765  SAM-dependent methyltransferase  41.67 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  37.39 
 
 		 285 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  32.98 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  32.43 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 264 aa  48.9  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  34.15 
 
 		 198 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.32 
 
 		 258 aa  48.5  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 337 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  35.25 
 
 		 304 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.59 
 
 		 257 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0941  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.85 
 
 		 256 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.05 
 
 		 291 aa  45.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  35 
 
 		 190 aa  45.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7221  putative 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.41 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  32.48 
 
 		 335 aa  44.3  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2754  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02124  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.85 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.369264  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.13 
 
 		 243 aa  43.9  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1044  thiopurine S-methyltransferase  27.46 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.3 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.3 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1335  thiopurine S-methyltransferase  31.19 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.357714  normal  0.249903 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  27.13 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.92 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.167435  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.13 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.13 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 285 aa  43.5  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.13 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1601  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.13 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.767111  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1311  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.92 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2847  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.92 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.170371  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  31.55 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0567  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.45 
 
 		 293 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  33.14 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 257 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1554  hypothetical protein  26.42 
 
 		 315 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000923024  normal  0.0128521 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.03 
 
 		 247 aa  42.4  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 243 aa  42.4  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  26.38 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  24.14 
 
 		 283 aa  42  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.66 
 
 		 264 aa  42  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  29.11 
 
 		 235 aa  42  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  27.69 
 
 		 211 aa  42  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  27.05 
 
 		 200 aa  42  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0827  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.82 
 
 		 256 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3130  hypothetical protein  33.33 
 
 		 305 aa  41.6  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  25.25 
 
 		 237 aa  41.6  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.37 
 
 		 250 aa  41.2  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>