54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4228 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4228  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  396  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2954  hypothetical protein  41.3 
 
 		 245 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.626632  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  36.03 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1053  protein of unknown function DUF1275  30.91 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2153  membrane protein-like protein  30.86 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0326  protein of unknown function DUF1275  30 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4285  hypothetical protein  32.12 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.108694  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  33.76 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  33.76 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4098  hypothetical protein  31.61 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0804  hypothetical protein  31.14 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3178  hypothetical protein  34.21 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0680  protein of unknown function DUF1275  34.38 
 
 		 259 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.265496 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3838  protein of unknown function DUF1275  29.05 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.036999  normal  0.190043 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  28.21 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6355  hypothetical protein  36.59 
 
 		 232 aa  48.9  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.286548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  34.38 
 
 		 234 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  39.66 
 
 		 233 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0144  protein of unknown function DUF1275  33.33 
 
 		 229 aa  48.1  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  39.66 
 
 		 233 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3003  hypothetical protein  36.59 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3053  hypothetical protein  35.37 
 
 		 282 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  34.94 
 
 		 264 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0258  hypothetical protein  36 
 
 		 246 aa  45.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4851  hypothetical protein  31.17 
 
 		 240 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0483  hypothetical protein  35 
 
 		 246 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  32.85 
 
 		 658 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3335  hypothetical protein  35 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4207  protein of unknown function DUF1275  29.81 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.249514  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3343  hypothetical protein  35 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0287  hypothetical protein  35 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2081  hypothetical protein  35 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3012  hypothetical protein  35 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0299  hypothetical protein  34 
 
 		 246 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3028  hypothetical protein  38.37 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2918  hypothetical protein  34.57 
 
 		 273 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3009  hypothetical protein  38.37 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1276  hypothetical protein  30.25 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2395  hypothetical protein  38.37 
 
 		 248 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.844909  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  45.21 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  27.67 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19360  predicted membrane protein  32.08 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0604968  normal  0.138211 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0238  putative permease transmembrane protein  28.39 
 
 		 236 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0180  hypothetical protein  34.92 
 
 		 236 aa  43.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000389961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5622  protein of unknown function DUF1275  27.21 
 
 		 264 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368186  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1310  hypothetical protein  29.63 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.109342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0118  hypothetical protein  31.61 
 
 		 224 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0128  hypothetical protein  31.61 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3145  protein of unknown function DUF1275  29.87 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0137  hypothetical protein  31.61 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  53.85 
 
 		 214 aa  42.4  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  53.85 
 
 		 214 aa  42.4  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  42.86 
 
 		 214 aa  41.6  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  34.48 
 
 		 250 aa  41.2  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>